Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Rpap1Q80TE0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Rpap1Q80TE0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Rpap1Q80TE0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Rpap1Q80TE0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Rpap1Q80TE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Rpap1Q80TE0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Rpap1Q80TE0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Rpap1Q80TE0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Rpap1Q80TE0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Rpap1Q80TE0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.82■■■■■ 4.76
Rpap1Q80TE0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Rpap1Q80TE0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Rpap1Q80TE0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Rpap1Q80TE0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Rpap1Q80TE0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
Rpap1Q80TE0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
Rpap1Q80TE0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Rpap1Q80TE0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Rpap1Q80TE0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Rpap1Q80TE0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Rpap1Q80TE0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Rpap1Q80TE0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Rpap1Q80TE0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Rpap1Q80TE0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Rpap1Q80TE0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rpap1Q80TE0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Rpap1Q80TE0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rpap1Q80TE0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Rpap1Q80TE0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Rpap1Q80TE0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Rpap1Q80TE0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Rpap1Q80TE0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Rpap1Q80TE0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Rpap1Q80TE0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Rpap1Q80TE0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Rpap1Q80TE0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.64
Rpap1Q80TE0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Rpap1Q80TE0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Rpap1Q80TE0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Rpap1Q80TE0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
Rpap1Q80TE0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
Rpap1Q80TE0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rpap1Q80TE0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Rpap1Q80TE0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Rpap1Q80TE0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Rpap1Q80TE0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Rpap1Q80TE0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Rpap1Q80TE0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Rpap1Q80TE0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Rpap1Q80TE0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
Rpap1Q80TE0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Rpap1Q80TE0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rpap1Q80TE0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rpap1Q80TE0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Rpap1Q80TE0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Rpap1Q80TE0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rpap1Q80TE0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Rpap1Q80TE0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Rpap1Q80TE0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Rpap1Q80TE0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Rpap1Q80TE0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Rpap1Q80TE0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rpap1Q80TE0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Rpap1Q80TE0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Rpap1Q80TE0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Rpap1Q80TE0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Rpap1Q80TE0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Rpap1Q80TE0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rpap1Q80TE0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rpap1Q80TE0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rpap1Q80TE0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Rpap1Q80TE0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Rpap1Q80TE0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Rpap1Q80TE0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Rpap1Q80TE0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Rpap1Q80TE0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
Rpap1Q80TE0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rpap1Q80TE0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rpap1Q80TE0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Rpap1Q80TE0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Rpap1Q80TE0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Rpap1Q80TE0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Rpap1Q80TE0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Rpap1Q80TE0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Rpap1Q80TE0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Rpap1Q80TE0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Rpap1Q80TE0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Rpap1Q80TE0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Rpap1Q80TE0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Rpap1Q80TE0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Rpap1Q80TE0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Rpap1Q80TE0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Rpap1Q80TE0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Rpap1Q80TE0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Rpap1Q80TE0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Rpap1Q80TE0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Rpap1Q80TE0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Rpap1Q80TE0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Rpap1Q80TE0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms