Protein: Q7Z407

CSMD3, CUB and sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD3Q7Z407 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSMD3Q7Z407 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSMD3Q7Z407 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSMD3Q7Z407 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSMD3Q7Z407 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSMD3Q7Z407 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSMD3Q7Z407 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSMD3Q7Z407 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSMD3Q7Z407 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSMD3Q7Z407 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSMD3Q7Z407 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSMD3Q7Z407 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSMD3Q7Z407 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSMD3Q7Z407 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSMD3Q7Z407 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSMD3Q7Z407 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSMD3Q7Z407 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSMD3Q7Z407 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSMD3Q7Z407 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSMD3Q7Z407 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSMD3Q7Z407 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSMD3Q7Z407 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSMD3Q7Z407 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSMD3Q7Z407 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSMD3Q7Z407 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSMD3Q7Z407 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSMD3Q7Z407 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSMD3Q7Z407 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSMD3Q7Z407 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSMD3Q7Z407 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSMD3Q7Z407 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSMD3Q7Z407 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD3Q7Z407 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSMD3Q7Z407 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSMD3Q7Z407 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD3Q7Z407 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSMD3Q7Z407 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSMD3Q7Z407 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSMD3Q7Z407 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSMD3Q7Z407 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSMD3Q7Z407 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSMD3Q7Z407 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSMD3Q7Z407 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSMD3Q7Z407 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSMD3Q7Z407 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSMD3Q7Z407 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSMD3Q7Z407 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSMD3Q7Z407 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSMD3Q7Z407 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSMD3Q7Z407 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSMD3Q7Z407 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSMD3Q7Z407 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSMD3Q7Z407 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSMD3Q7Z407 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSMD3Q7Z407 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSMD3Q7Z407 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSMD3Q7Z407 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSMD3Q7Z407 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSMD3Q7Z407 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSMD3Q7Z407 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSMD3Q7Z407 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSMD3Q7Z407 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSMD3Q7Z407 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSMD3Q7Z407 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSMD3Q7Z407 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSMD3Q7Z407 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSMD3Q7Z407 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSMD3Q7Z407 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSMD3Q7Z407 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSMD3Q7Z407 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSMD3Q7Z407 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSMD3Q7Z407 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSMD3Q7Z407 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSMD3Q7Z407 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSMD3Q7Z407 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSMD3Q7Z407 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSMD3Q7Z407 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSMD3Q7Z407 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSMD3Q7Z407 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSMD3Q7Z407 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSMD3Q7Z407 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSMD3Q7Z407 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSMD3Q7Z407 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSMD3Q7Z407 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSMD3Q7Z407 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSMD3Q7Z407 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSMD3Q7Z407 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSMD3Q7Z407 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSMD3Q7Z407 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSMD3Q7Z407 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSMD3Q7Z407 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 715.9 ms