Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC69.63■■■■■ 8.74
Rtl1Q7M732 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC64.62■■■■■ 7.94
Rtl1Q7M732 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.06■■■■■ 7.68
Rtl1Q7M732 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.63■■■■■ 7.46
Rtl1Q7M732 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC61.16■■■■■ 7.38
Rtl1Q7M732 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC60.61■■■■■ 7.29
Rtl1Q7M732 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC60.22■■■■■ 7.23
Rtl1Q7M732 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.79■■■■■ 7.16
Rtl1Q7M732 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.41■■■■■ 7.1
Rtl1Q7M732 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.11■■■■■ 7.05
Rtl1Q7M732 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.87■■■■■ 7.01
Rtl1Q7M732 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC58.18■■■■■ 6.9
Rtl1Q7M732 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC58.09■■■■■ 6.89
Rtl1Q7M732 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.9■■■■■ 6.86
Rtl1Q7M732 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.5■■■■■ 6.8
Rtl1Q7M732 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC57.11■■■■■ 6.73
Rtl1Q7M732 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC56.7■■■■■ 6.67
Rtl1Q7M732 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.58■■■■■ 6.65
Rtl1Q7M732 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.35■■■■■ 6.61
Rtl1Q7M732 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.61
Rtl1Q7M732 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.24■■■■■ 6.59
Rtl1Q7M732 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC56.17■■■■■ 6.58
Rtl1Q7M732 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.05■■■■■ 6.56
Rtl1Q7M732 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.91■■■■■ 6.54
Rtl1Q7M732 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC55.83■■■■■ 6.53
Rtl1Q7M732 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC55.8■■■■■ 6.52
Rtl1Q7M732 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.74■■■■■ 6.51
Rtl1Q7M732 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC55.68■■■■■ 6.5
Rtl1Q7M732 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.53■■■■■ 6.48
Rtl1Q7M732 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.4■■■■■ 6.46
Rtl1Q7M732 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC55.38■■■■■ 6.46
Rtl1Q7M732 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.2■■■■■ 6.43
Rtl1Q7M732 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
Rtl1Q7M732 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
Rtl1Q7M732 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.1■■■■■ 6.41
Rtl1Q7M732 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC54.82■■■■■ 6.37
Rtl1Q7M732 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC54.81■■■■■ 6.36
Rtl1Q7M732 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
Rtl1Q7M732 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.78■■■■■ 6.36
Rtl1Q7M732 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC54.56■■■■■ 6.32
Rtl1Q7M732 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
Rtl1Q7M732 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
Rtl1Q7M732 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
Rtl1Q7M732 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.99■■■■■ 6.23
Rtl1Q7M732 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
Rtl1Q7M732 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
Rtl1Q7M732 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC53.7■■■■■ 6.19
Rtl1Q7M732 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
Rtl1Q7M732 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC53.67■■■■■ 6.18
Rtl1Q7M732 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
Rtl1Q7M732 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.17
Rtl1Q7M732 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC53.51■■■■■ 6.16
Rtl1Q7M732 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
Rtl1Q7M732 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
Rtl1Q7M732 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC53.17■■■■■ 6.1
Rtl1Q7M732 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
Rtl1Q7M732 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
Rtl1Q7M732 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.99■■■■■ 6.07
Rtl1Q7M732 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC52.96■■■■■ 6.07
Rtl1Q7M732 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC52.84■■■■■ 6.05
Rtl1Q7M732 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC52.83■■■■■ 6.05
Rtl1Q7M732 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
Rtl1Q7M732 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
Rtl1Q7M732 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.65■■■■■ 6.02
Rtl1Q7M732 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC52.57■■■■■ 6.01
Rtl1Q7M732 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
Rtl1Q7M732 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC52.39■■■■■ 5.98
Rtl1Q7M732 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
Rtl1Q7M732 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.97
Rtl1Q7M732 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.31■■■■■ 5.96
Rtl1Q7M732 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
Rtl1Q7M732 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC52.23■■■■■ 5.95
Rtl1Q7M732 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC52.18■■■■■ 5.94
Rtl1Q7M732 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
Rtl1Q7M732 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
Rtl1Q7M732 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
Rtl1Q7M732 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
Rtl1Q7M732 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
Rtl1Q7M732 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
Rtl1Q7M732 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
Rtl1Q7M732 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC51.91■■■■■ 5.9
Rtl1Q7M732 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
Rtl1Q7M732 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Rtl1Q7M732 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
Rtl1Q7M732 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC51.72■■■■■ 5.87
Rtl1Q7M732 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC51.61■■■■■ 5.85
Rtl1Q7M732 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC51.59■■■■■ 5.85
Rtl1Q7M732 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC51.57■■■■■ 5.85
Rtl1Q7M732 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC51.56■■■■■ 5.84
Rtl1Q7M732 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
Rtl1Q7M732 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
Rtl1Q7M732 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC51.45■■■■■ 5.83
Rtl1Q7M732 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
Rtl1Q7M732 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
Rtl1Q7M732 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC51.34■■■■■ 5.81
Rtl1Q7M732 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
Rtl1Q7M732 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
Rtl1Q7M732 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC51.24■■■■■ 5.79
Rtl1Q7M732 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
Rtl1Q7M732 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms