Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS13CQ709C8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS13CQ709C8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS13CQ709C8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS13CQ709C8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS13CQ709C8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS13CQ709C8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS13CQ709C8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS13CQ709C8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS13CQ709C8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS13CQ709C8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS13CQ709C8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS13CQ709C8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS13CQ709C8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS13CQ709C8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS13CQ709C8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS13CQ709C8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS13CQ709C8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS13CQ709C8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS13CQ709C8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS13CQ709C8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS13CQ709C8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS13CQ709C8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS13CQ709C8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS13CQ709C8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS13CQ709C8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS13CQ709C8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS13CQ709C8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS13CQ709C8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS13CQ709C8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS13CQ709C8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS13CQ709C8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS13CQ709C8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS13CQ709C8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS13CQ709C8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS13CQ709C8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS13CQ709C8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS13CQ709C8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS13CQ709C8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS13CQ709C8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS13CQ709C8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS13CQ709C8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS13CQ709C8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS13CQ709C8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS13CQ709C8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS13CQ709C8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13CQ709C8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13CQ709C8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS13CQ709C8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS13CQ709C8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS13CQ709C8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS13CQ709C8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS13CQ709C8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS13CQ709C8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS13CQ709C8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS13CQ709C8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS13CQ709C8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS13CQ709C8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS13CQ709C8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS13CQ709C8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS13CQ709C8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS13CQ709C8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS13CQ709C8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS13CQ709C8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS13CQ709C8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS13CQ709C8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS13CQ709C8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS13CQ709C8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS13CQ709C8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS13CQ709C8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS13CQ709C8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS13CQ709C8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS13CQ709C8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS13CQ709C8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS13CQ709C8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS13CQ709C8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS13CQ709C8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS13CQ709C8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS13CQ709C8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS13CQ709C8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS13CQ709C8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS13CQ709C8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS13CQ709C8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS13CQ709C8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS13CQ709C8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS13CQ709C8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS13CQ709C8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS13CQ709C8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS13CQ709C8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS13CQ709C8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS13CQ709C8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS13CQ709C8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS13CQ709C8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms