Protein: Q6ZN17

LIN28B, Protein lin-28 homolog B, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28BQ6ZN17 RPS13-207ENST00000531008 594 ntTSL 24.79□□□□□ -1.641e-323■■■■■ 614.3
LIN28BQ6ZN17 RPS13-205ENST00000527571 777 ntTSL 219.65■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 562.2
LIN28BQ6ZN17 RPS13-206ENST00000528074 583 ntTSL 218.1■□□□□ 0.491e-323■■■■■ 562.2
LIN28BQ6ZN17 RPS13-210ENST00000534329 568 ntTSL 215.55■□□□□ 0.081e-323■■■■■ 562.2
LIN28BQ6ZN17 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 219.66■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 556
LIN28BQ6ZN17 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 316.43■□□□□ 0.221e-323■■■■■ 556
LIN28BQ6ZN17 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-323■■■■■ 556
LIN28BQ6ZN17 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-323■■■■■ 556
LIN28BQ6ZN17 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-323■■■■■ 556
LIN28BQ6ZN17 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 24.87□□□□□ -1.631e-323■■■■■ 542.1
LIN28BQ6ZN17 HK1-217ENST00000494253 2848 ntTSL 212.98□□□□□ -0.337e-21■■■■■ 385
LIN28BQ6ZN17 LARP1-214ENST00000524187 287 ntTSL 25.09□□□□□ -1.593e-26■■■■■ 290.9
LIN28BQ6ZN17 PRIM1-207ENST00000552408 566 ntTSL 34.21□□□□□ -1.742e-94■■■■■ 288.3
LIN28BQ6ZN17 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 276.5
LIN28BQ6ZN17 HK1-216ENST00000493591 916 ntTSL 56.24□□□□□ -1.416e-87■■■■■ 269.4
LIN28BQ6ZN17 RPL18-216ENST00000552851 691 ntTSL 514.39□□□□□ -0.113e-13■■■■■ 266
LIN28BQ6ZN17 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 265.8
LIN28BQ6ZN17 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 265.8
LIN28BQ6ZN17 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-9■■■■■ 265.8
LIN28BQ6ZN17 EMP2-202ENST00000359543 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.659e-30■■■■■ 261.7
LIN28BQ6ZN17 STIM1-205ENST00000526156 1024 ntTSL 213.27□□□□□ -0.294e-20■■■■■ 255.2
LIN28BQ6ZN17 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.356e-35■■■■■ 241.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 326.57■■□□□ 1.844e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 526.04■■□□□ 1.764e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 225.81■■□□□ 1.724e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.544e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.534e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.534e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 321.14■□□□□ 0.974e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.814e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 219.01■□□□□ 0.634e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.064e-32■■■■■ 238.3
LIN28BQ6ZN17 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 219
LIN28BQ6ZN17 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 219
LIN28BQ6ZN17 STIM1-218ENST00000533977 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 219
LIN28BQ6ZN17 RPL18-211ENST00000550973 1111 ntTSL 523.16■■□□□ 1.33e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.773e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-201ENST00000084795 612 ntTSL 1 (best)19.84■□□□□ 0.773e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-213ENST00000552347 1645 ntTSL 519.53■□□□□ 0.723e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-206ENST00000549370 628 ntTSL 518.1■□□□□ 0.493e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-202ENST00000546623 541 ntTSL 517.95■□□□□ 0.463e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-212ENST00000551749 2091 ntTSL 217.24■□□□□ 0.353e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-204ENST00000547897 440 ntTSL 515.19■□□□□ 0.023e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -03e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-215ENST00000552705 1081 ntTSL 214.51□□□□□ -0.093e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 RPL18-203ENST00000547892 3844 nt11.86□□□□□ -0.513e-69■■■■■ 218
LIN28BQ6ZN17 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 204.5
LIN28BQ6ZN17 PRIM1-206ENST00000550770 1008 ntTSL 512.58□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 204.5
LIN28BQ6ZN17 PRIM1-208ENST00000552590 1459 ntTSL 510.13□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 204.5
LIN28BQ6ZN17 PRIM1-203ENST00000548173 590 ntTSL 48.94□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 204.5
LIN28BQ6ZN17 PRIM1-205ENST00000550224 1206 ntTSL 57.15□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 204.5
LIN28BQ6ZN17 PRIM1-202ENST00000546761 381 ntTSL 35.34□□□□□ -1.556e-7■■■■■ 204.5
LIN28BQ6ZN17 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.034e-35■■■■■ 203.5
LIN28BQ6ZN17 DOCK2-214ENST00000523351 3777 ntTSL 59.34□□□□□ -0.928e-20■■■■■ 195.5
LIN28BQ6ZN17 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.38e-20■■■■■ 195.5
LIN28BQ6ZN17 PRCP-213ENST00000532709 2521 ntTSL 28.41□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 189.7
LIN28BQ6ZN17 PRCP-210ENST00000531283 565 ntTSL 35.22□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 189.7
LIN28BQ6ZN17 PRCP-203ENST00000524642 460 ntTSL 25.01□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 189.7
LIN28BQ6ZN17 PRCP-204ENST00000525772 666 ntTSL 34.53□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 189.7
LIN28BQ6ZN17 PRCP-205ENST00000526918 537 ntTSL 44.51□□□□□ -1.693e-7■■■■■ 189.7
LIN28BQ6ZN17 PRCP-212ENST00000532476 571 ntTSL 43.31□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 189.7
LIN28BQ6ZN17 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.316e-41■■■■■ 185.6
LIN28BQ6ZN17 SEC23A-209ENST00000555363 704 ntTSL 25.03□□□□□ -1.64e-22■■■■■ 176.8
LIN28BQ6ZN17 SEC23A-207ENST00000554615 3813 ntTSL 1 (best)3.23□□□□□ -1.894e-22■■■■■ 176.8
LIN28BQ6ZN17 RPL18-210ENST00000550671 764 ntTSL 214.32□□□□□ -0.127e-13■■■■■ 176
LIN28BQ6ZN17 RPS27A-204ENST00000449323 422 ntTSL 34.4□□□□□ -1.711e-17■■■■■ 174.6
LIN28BQ6ZN17 CCT2-214ENST00000553169 758 ntTSL 29.07□□□□□ -0.966e-54■■■■■ 170.5
LIN28BQ6ZN17 IQGAP1-215ENST00000561086 2871 ntTSL 23.78□□□□□ -1.89e-64■■■■■ 169
LIN28BQ6ZN17 IQGAP1-204ENST00000558957 2313 ntTSL 22.66□□□□□ -1.989e-64■■■■■ 169
LIN28BQ6ZN17 RPS27A-208ENST00000478196 580 ntTSL 24.4□□□□□ -1.711e-17■■■■■ 167.6
LIN28BQ6ZN17 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-31■■■■■ 165.4
LIN28BQ6ZN17 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-31■■■■■ 165.4
LIN28BQ6ZN17 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.623e-12■■■■■ 164.4
LIN28BQ6ZN17 DOCK2-216ENST00000524185 5656 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.143e-12■■■■■ 164.4
LIN28BQ6ZN17 KIF3B-201ENST00000375712 6103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-42■■■■■ 151.4
LIN28BQ6ZN17 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 150.4
LIN28BQ6ZN17 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 150.4
LIN28BQ6ZN17 AC005381.1-201ENST00000593065 769 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.324e-12■■■■■ 146.5
LIN28BQ6ZN17 UBN1-203ENST00000585857 545 ntTSL 415.72■□□□□ 0.112e-19■■■■■ 142.9
LIN28BQ6ZN17 UBN1-206ENST00000587027 837 ntTSL 315.09■□□□□ 0.012e-19■■■■■ 142.9
LIN28BQ6ZN17 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-19■■■■■ 142.9
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.65e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-204ENST00000595319 776 ntTSL 526■■□□□ 1.755e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-211ENST00000600491 1493 ntTSL 224.59■■□□□ 1.535e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-206ENST00000596543 545 ntTSL 417.61■□□□□ 0.415e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-207ENST00000596673 586 ntTSL 316.98■□□□□ 0.315e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-212ENST00000600677 2022 ntTSL 515.5■□□□□ 0.075e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.015e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-203ENST00000595305 2068 ntTSL 214.56□□□□□ -0.085e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-205ENST00000596078 1010 ntTSL 514.17□□□□□ -0.145e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 TRIP10-213ENST00000601303 311 ntTSL 54.69□□□□□ -1.665e-33■■■■■ 141.2
LIN28BQ6ZN17 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 139.7
LIN28BQ6ZN17 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.214e-22■■■■■ 138.8
LIN28BQ6ZN17 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-22■■■■■ 138.8
LIN28BQ6ZN17 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.774e-22■■■■■ 138.8
Retrieved 100 of 21,972 protein–RNA pairs in 635.6 ms