Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CCDC18Q5T9S5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CCDC18Q5T9S5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
CCDC18Q5T9S5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
CCDC18Q5T9S5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
CCDC18Q5T9S5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC18Q5T9S5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC18Q5T9S5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC18Q5T9S5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CCDC18Q5T9S5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CCDC18Q5T9S5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CCDC18Q5T9S5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CCDC18Q5T9S5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
CCDC18Q5T9S5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CCDC18Q5T9S5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC18Q5T9S5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC18Q5T9S5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CCDC18Q5T9S5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC18Q5T9S5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCDC18Q5T9S5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCDC18Q5T9S5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC18Q5T9S5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC18Q5T9S5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC18Q5T9S5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CCDC18Q5T9S5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC18Q5T9S5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC18Q5T9S5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC18Q5T9S5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CCDC18Q5T9S5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC18Q5T9S5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
CCDC18Q5T9S5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC18Q5T9S5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CCDC18Q5T9S5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC18Q5T9S5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CCDC18Q5T9S5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CCDC18Q5T9S5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC18Q5T9S5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC18Q5T9S5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC18Q5T9S5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC18Q5T9S5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC18Q5T9S5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC18Q5T9S5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CCDC18Q5T9S5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC18Q5T9S5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
CCDC18Q5T9S5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC18Q5T9S5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CCDC18Q5T9S5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC18Q5T9S5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC18Q5T9S5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
CCDC18Q5T9S5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC18Q5T9S5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC18Q5T9S5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
CCDC18Q5T9S5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC18Q5T9S5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC18Q5T9S5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC18Q5T9S5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC18Q5T9S5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC18Q5T9S5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC18Q5T9S5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC18Q5T9S5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCDC18Q5T9S5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC18Q5T9S5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
CCDC18Q5T9S5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC18Q5T9S5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
CCDC18Q5T9S5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CCDC18Q5T9S5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
CCDC18Q5T9S5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CCDC18Q5T9S5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC18Q5T9S5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC18Q5T9S5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CCDC18Q5T9S5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CCDC18Q5T9S5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CCDC18Q5T9S5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC18Q5T9S5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC18Q5T9S5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CCDC18Q5T9S5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC18Q5T9S5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC18Q5T9S5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CCDC18Q5T9S5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC18Q5T9S5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC18Q5T9S5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC18Q5T9S5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CCDC18Q5T9S5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CCDC18Q5T9S5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC18Q5T9S5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC18Q5T9S5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC18Q5T9S5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
CCDC18Q5T9S5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC18Q5T9S5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC18Q5T9S5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC18Q5T9S5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC18Q5T9S5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC18Q5T9S5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
CCDC18Q5T9S5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
CCDC18Q5T9S5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CCDC18Q5T9S5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CCDC18Q5T9S5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC18Q5T9S5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms