Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.34■■■■■ 6.29
CCDC18Q5T9S5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.48■■■■■ 6.15
CCDC18Q5T9S5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
CCDC18Q5T9S5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
CCDC18Q5T9S5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.59■■■■■ 6.01
CCDC18Q5T9S5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
CCDC18Q5T9S5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.42■■■■■ 5.98
CCDC18Q5T9S5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.13■■■■■ 5.94
CCDC18Q5T9S5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.15■■■■■ 5.78
CCDC18Q5T9S5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
CCDC18Q5T9S5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.98■■■■■ 5.75
CCDC18Q5T9S5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CCDC18Q5T9S5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
CCDC18Q5T9S5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.81■■■■■ 5.72
CCDC18Q5T9S5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
CCDC18Q5T9S5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC18Q5T9S5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC18Q5T9S5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
CCDC18Q5T9S5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.19■■■■■ 5.62
CCDC18Q5T9S5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
CCDC18Q5T9S5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
CCDC18Q5T9S5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
CCDC18Q5T9S5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
CCDC18Q5T9S5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
CCDC18Q5T9S5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
CCDC18Q5T9S5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
CCDC18Q5T9S5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
CCDC18Q5T9S5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.32■■■■■ 5.49
CCDC18Q5T9S5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
CCDC18Q5T9S5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
CCDC18Q5T9S5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
CCDC18Q5T9S5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
CCDC18Q5T9S5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.7■■■■■ 5.39
CCDC18Q5T9S5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
CCDC18Q5T9S5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
CCDC18Q5T9S5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
CCDC18Q5T9S5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
CCDC18Q5T9S5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
CCDC18Q5T9S5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
CCDC18Q5T9S5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.42■■■■■ 5.34
CCDC18Q5T9S5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.39■■■■■ 5.34
CCDC18Q5T9S5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.34■■■■■ 5.33
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
CCDC18Q5T9S5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CCDC18Q5T9S5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
CCDC18Q5T9S5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
CCDC18Q5T9S5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
CCDC18Q5T9S5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
CCDC18Q5T9S5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
CCDC18Q5T9S5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
CCDC18Q5T9S5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
CCDC18Q5T9S5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
CCDC18Q5T9S5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
CCDC18Q5T9S5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCDC18Q5T9S5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.06■■■■■ 5.12
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
CCDC18Q5T9S5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.06■■■■■ 5.12
CCDC18Q5T9S5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC18Q5T9S5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC18Q5T9S5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
CCDC18Q5T9S5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC18Q5T9S5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC18Q5T9S5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CCDC18Q5T9S5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC18Q5T9S5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC18Q5T9S5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC18Q5T9S5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC18Q5T9S5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
CCDC18Q5T9S5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CCDC18Q5T9S5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC18Q5T9S5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
CCDC18Q5T9S5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
CCDC18Q5T9S5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC18Q5T9S5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC18Q5T9S5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.64■■■■■ 5.06
CCDC18Q5T9S5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.63■■■■■ 5.06
CCDC18Q5T9S5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
CCDC18Q5T9S5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
CCDC18Q5T9S5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
CCDC18Q5T9S5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
CCDC18Q5T9S5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CCDC18Q5T9S5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
CCDC18Q5T9S5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
CCDC18Q5T9S5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
CCDC18Q5T9S5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.01
CCDC18Q5T9S5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CCDC18Q5T9S5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
CCDC18Q5T9S5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
CCDC18Q5T9S5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.31■■■■■ 5
CCDC18Q5T9S5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
CCDC18Q5T9S5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC18Q5T9S5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
CCDC18Q5T9S5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
CCDC18Q5T9S5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CCDC18Q5T9S5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
CCDC18Q5T9S5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CCDC18Q5T9S5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
CCDC18Q5T9S5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC18Q5T9S5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
CCDC18Q5T9S5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms