Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Scarf1Q5ND28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Scarf1Q5ND28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Scarf1Q5ND28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Scarf1Q5ND28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Scarf1Q5ND28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Scarf1Q5ND28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Scarf1Q5ND28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Scarf1Q5ND28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Scarf1Q5ND28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Scarf1Q5ND28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Scarf1Q5ND28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scarf1Q5ND28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Scarf1Q5ND28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Scarf1Q5ND28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Scarf1Q5ND28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Scarf1Q5ND28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Scarf1Q5ND28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Scarf1Q5ND28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scarf1Q5ND28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Scarf1Q5ND28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Scarf1Q5ND28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scarf1Q5ND28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Scarf1Q5ND28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Scarf1Q5ND28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Scarf1Q5ND28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Scarf1Q5ND28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Scarf1Q5ND28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Scarf1Q5ND28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Scarf1Q5ND28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Scarf1Q5ND28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Scarf1Q5ND28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Scarf1Q5ND28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Scarf1Q5ND28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Scarf1Q5ND28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Scarf1Q5ND28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Scarf1Q5ND28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Scarf1Q5ND28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Scarf1Q5ND28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scarf1Q5ND28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scarf1Q5ND28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scarf1Q5ND28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Scarf1Q5ND28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Scarf1Q5ND28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Scarf1Q5ND28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Scarf1Q5ND28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Scarf1Q5ND28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Scarf1Q5ND28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scarf1Q5ND28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Scarf1Q5ND28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Scarf1Q5ND28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scarf1Q5ND28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Scarf1Q5ND28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scarf1Q5ND28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Scarf1Q5ND28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Scarf1Q5ND28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Scarf1Q5ND28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Scarf1Q5ND28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Scarf1Q5ND28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Scarf1Q5ND28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Scarf1Q5ND28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Scarf1Q5ND28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Scarf1Q5ND28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Scarf1Q5ND28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Scarf1Q5ND28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Scarf1Q5ND28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Scarf1Q5ND28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Scarf1Q5ND28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Scarf1Q5ND28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Scarf1Q5ND28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Scarf1Q5ND28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Scarf1Q5ND28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Scarf1Q5ND28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Scarf1Q5ND28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Scarf1Q5ND28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Scarf1Q5ND28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Scarf1Q5ND28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Scarf1Q5ND28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Scarf1Q5ND28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Scarf1Q5ND28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Scarf1Q5ND28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Scarf1Q5ND28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Scarf1Q5ND28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Scarf1Q5ND28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Scarf1Q5ND28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Scarf1Q5ND28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Scarf1Q5ND28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Scarf1Q5ND28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Scarf1Q5ND28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Scarf1Q5ND28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Scarf1Q5ND28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Scarf1Q5ND28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Scarf1Q5ND28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Scarf1Q5ND28 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Scarf1Q5ND28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Scarf1Q5ND28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Scarf1Q5ND28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Scarf1Q5ND28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Scarf1Q5ND28 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Scarf1Q5ND28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 629.4 ms