Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
Trim41Q5NCC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
Trim41Q5NCC3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Trim41Q5NCC3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
Trim41Q5NCC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
Trim41Q5NCC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC49.42■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC49.41■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC49.37■■■■■ 5.49
Trim41Q5NCC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
Trim41Q5NCC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
Trim41Q5NCC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
Trim41Q5NCC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
Trim41Q5NCC3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Trim41Q5NCC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
Trim41Q5NCC3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
Trim41Q5NCC3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Trim41Q5NCC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
Trim41Q5NCC3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
Trim41Q5NCC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
Trim41Q5NCC3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
Trim41Q5NCC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Trim41Q5NCC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
Trim41Q5NCC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
Trim41Q5NCC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC48.72■■■■■ 5.39
Trim41Q5NCC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC48.68■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Trim41Q5NCC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
Trim41Q5NCC3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC48.52■■■■■ 5.36
Trim41Q5NCC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Trim41Q5NCC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
Trim41Q5NCC3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC48.39■■■■■ 5.34
Trim41Q5NCC3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Trim41Q5NCC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Trim41Q5NCC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Trim41Q5NCC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Trim41Q5NCC3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
Trim41Q5NCC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC48.26■■■■■ 5.32
Trim41Q5NCC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
Trim41Q5NCC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Trim41Q5NCC3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Trim41Q5NCC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC48.17■■■■■ 5.3
Trim41Q5NCC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
Trim41Q5NCC3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
Trim41Q5NCC3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Trim41Q5NCC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Trim41Q5NCC3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Trim41Q5NCC3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Trim41Q5NCC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Trim41Q5NCC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
Trim41Q5NCC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
Trim41Q5NCC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC47.85■■■■■ 5.25
Trim41Q5NCC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Trim41Q5NCC3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC47.77■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Trim41Q5NCC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Trim41Q5NCC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
Trim41Q5NCC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Trim41Q5NCC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
Trim41Q5NCC3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
Trim41Q5NCC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Trim41Q5NCC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
Trim41Q5NCC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
Trim41Q5NCC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Trim41Q5NCC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Trim41Q5NCC3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
Trim41Q5NCC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Trim41Q5NCC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Trim41Q5NCC3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Trim41Q5NCC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Trim41Q5NCC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Trim41Q5NCC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC46.8■■■■■ 5.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms