Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC68.27■■■■■ 8.52
Trim41Q5NCC3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC64.12■■■■■ 7.86
Trim41Q5NCC3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.88■■■■■ 7.66
Trim41Q5NCC3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC60.35■■■■■ 7.25
Trim41Q5NCC3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC59.16■■■■■ 7.06
Trim41Q5NCC3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC57.99■■■■■ 6.87
Trim41Q5NCC3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.89■■■■■ 6.86
Trim41Q5NCC3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC57.88■■■■■ 6.86
Trim41Q5NCC3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.74■■■■■ 6.83
Trim41Q5NCC3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.56■■■■■ 6.8
Trim41Q5NCC3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.43■■■■■ 6.78
Trim41Q5NCC3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC56.95■■■■■ 6.71
Trim41Q5NCC3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.84■■■■■ 6.69
Trim41Q5NCC3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
Trim41Q5NCC3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC56.67■■■■■ 6.66
Trim41Q5NCC3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.55■■■■■ 6.64
Trim41Q5NCC3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC56.49■■■■■ 6.63
Trim41Q5NCC3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC56.02■■■■■ 6.56
Trim41Q5NCC3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.81■■■■■ 6.52
Trim41Q5NCC3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.3■■■■■ 6.44
Trim41Q5NCC3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.81■■■■■ 6.36
Trim41Q5NCC3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC54.72■■■■■ 6.35
Trim41Q5NCC3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC54.67■■■■■ 6.34
Trim41Q5NCC3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.66■■■■■ 6.34
Trim41Q5NCC3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC54.56■■■■■ 6.32
Trim41Q5NCC3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC54.51■■■■■ 6.32
Trim41Q5NCC3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
Trim41Q5NCC3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.27■■■■■ 6.28
Trim41Q5NCC3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.24■■■■■ 6.27
Trim41Q5NCC3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
Trim41Q5NCC3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.74■■■■■ 6.19
Trim41Q5NCC3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.18
Trim41Q5NCC3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC53.59■■■■■ 6.17
Trim41Q5NCC3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
Trim41Q5NCC3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
Trim41Q5NCC3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC53.47■■■■■ 6.15
Trim41Q5NCC3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
Trim41Q5NCC3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC53.22■■■■■ 6.11
Trim41Q5NCC3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.18■■■■■ 6.1
Trim41Q5NCC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
Trim41Q5NCC3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC52.9■■■■■ 6.06
Trim41Q5NCC3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.88■■■■■ 6.06
Trim41Q5NCC3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC52.74■■■■■ 6.03
Trim41Q5NCC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC52.6■■■■■ 6.01
Trim41Q5NCC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC52.49■■■■■ 5.99
Trim41Q5NCC3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC52.4■■■■■ 5.98
Trim41Q5NCC3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
Trim41Q5NCC3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC52.27■■■■■ 5.96
Trim41Q5NCC3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC52.26■■■■■ 5.96
Trim41Q5NCC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.24■■■■■ 5.95
Trim41Q5NCC3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC52.2■■■■■ 5.95
Trim41Q5NCC3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
Trim41Q5NCC3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC51.89■■■■■ 5.9
Trim41Q5NCC3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
Trim41Q5NCC3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
Trim41Q5NCC3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
Trim41Q5NCC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
Trim41Q5NCC3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC51.59■■■■■ 5.85
Trim41Q5NCC3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
Trim41Q5NCC3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC51.44■■■■■ 5.82
Trim41Q5NCC3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC51.41■■■■■ 5.82
Trim41Q5NCC3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
Trim41Q5NCC3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
Trim41Q5NCC3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC51.04■■■■■ 5.76
Trim41Q5NCC3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC51.02■■■■■ 5.76
Trim41Q5NCC3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
Trim41Q5NCC3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
Trim41Q5NCC3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
Trim41Q5NCC3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
Trim41Q5NCC3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.7
Trim41Q5NCC3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
Trim41Q5NCC3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
Trim41Q5NCC3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
Trim41Q5NCC3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
Trim41Q5NCC3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC50.45■■■■■ 5.67
Trim41Q5NCC3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
Trim41Q5NCC3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
Trim41Q5NCC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC50.28■■■■■ 5.64
Trim41Q5NCC3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
Trim41Q5NCC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC50.24■■■■■ 5.63
Trim41Q5NCC3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
Trim41Q5NCC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
Trim41Q5NCC3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC50.16■■■■■ 5.62
Trim41Q5NCC3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
Trim41Q5NCC3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
Trim41Q5NCC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
Trim41Q5NCC3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
Trim41Q5NCC3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Trim41Q5NCC3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC50.04■■■■■ 5.6
Trim41Q5NCC3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
Trim41Q5NCC3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
Trim41Q5NCC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
Trim41Q5NCC3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
Trim41Q5NCC3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC49.8■■■■■ 5.56
Trim41Q5NCC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
Trim41Q5NCC3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
Trim41Q5NCC3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
Trim41Q5NCC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC49.75■■■■■ 5.55
Trim41Q5NCC3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
Trim41Q5NCC3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms