Protein: Q4QRL3

Ccdc88b, Coiled-coil domain-containing protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88bQ4QRL3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.88■■■■■ 7.98
Ccdc88bQ4QRL3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC60.08■■■■■ 7.21
Ccdc88bQ4QRL3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.91■■■■■ 7.02
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC56.64■■■■■ 6.66
Ccdc88bQ4QRL3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.45■■■■■ 6.63
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC55.6■■■■■ 6.49
Ccdc88bQ4QRL3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.57■■■■■ 6.49
Ccdc88bQ4QRL3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.77■■■■■ 6.36
Ccdc88bQ4QRL3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.72■■■■■ 6.35
Ccdc88bQ4QRL3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
Ccdc88bQ4QRL3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC54.03■■■■■ 6.24
Ccdc88bQ4QRL3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.01■■■■■ 6.24
Ccdc88bQ4QRL3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
Ccdc88bQ4QRL3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.64■■■■■ 6.18
Ccdc88bQ4QRL3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
Ccdc88bQ4QRL3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
Ccdc88bQ4QRL3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.46■■■■■ 5.99
Ccdc88bQ4QRL3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC52.33■■■■■ 5.97
Ccdc88bQ4QRL3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.23■■■■■ 5.95
Ccdc88bQ4QRL3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.19■■■■■ 5.95
Ccdc88bQ4QRL3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC52.09■■■■■ 5.93
Ccdc88bQ4QRL3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
Ccdc88bQ4QRL3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.78■■■■■ 5.88
Ccdc88bQ4QRL3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
Ccdc88bQ4QRL3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
Ccdc88bQ4QRL3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
Ccdc88bQ4QRL3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
Ccdc88bQ4QRL3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
Ccdc88bQ4QRL3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
Ccdc88bQ4QRL3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC51.33■■■■■ 5.81
Ccdc88bQ4QRL3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
Ccdc88bQ4QRL3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC51.28■■■■■ 5.8
Ccdc88bQ4QRL3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
Ccdc88bQ4QRL3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC51.12■■■■■ 5.77
Ccdc88bQ4QRL3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.98■■■■■ 5.75
Ccdc88bQ4QRL3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
Ccdc88bQ4QRL3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
Ccdc88bQ4QRL3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
Ccdc88bQ4QRL3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.17■■■■■ 5.62
Ccdc88bQ4QRL3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.57
Ccdc88bQ4QRL3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
Ccdc88bQ4QRL3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
Ccdc88bQ4QRL3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
Ccdc88bQ4QRL3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
Ccdc88bQ4QRL3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC49.63■■■■■ 5.53
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
Ccdc88bQ4QRL3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
Ccdc88bQ4QRL3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.5■■■■■ 5.51
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.48■■■■■ 5.51
Ccdc88bQ4QRL3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
Ccdc88bQ4QRL3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
Ccdc88bQ4QRL3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
Ccdc88bQ4QRL3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
Ccdc88bQ4QRL3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
Ccdc88bQ4QRL3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
Ccdc88bQ4QRL3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Ccdc88bQ4QRL3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Ccdc88bQ4QRL3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
Ccdc88bQ4QRL3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC48.69■■■■■ 5.39
Ccdc88bQ4QRL3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
Ccdc88bQ4QRL3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
Ccdc88bQ4QRL3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC48.49■■■■■ 5.35
Ccdc88bQ4QRL3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ccdc88bQ4QRL3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ccdc88bQ4QRL3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC48.36■■■■■ 5.33
Ccdc88bQ4QRL3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Ccdc88bQ4QRL3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Ccdc88bQ4QRL3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
Ccdc88bQ4QRL3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Ccdc88bQ4QRL3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC48.19■■■■■ 5.31
Ccdc88bQ4QRL3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Ccdc88bQ4QRL3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
Ccdc88bQ4QRL3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC48.17■■■■■ 5.3
Ccdc88bQ4QRL3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
Ccdc88bQ4QRL3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
Ccdc88bQ4QRL3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Ccdc88bQ4QRL3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC47.9■■■■■ 5.26
Ccdc88bQ4QRL3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Ccdc88bQ4QRL3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Ccdc88bQ4QRL3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Ccdc88bQ4QRL3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Ccdc88bQ4QRL3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
Ccdc88bQ4QRL3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
Ccdc88bQ4QRL3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Ccdc88bQ4QRL3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47.69■■■■■ 5.23
Ccdc88bQ4QRL3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
Ccdc88bQ4QRL3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
Ccdc88bQ4QRL3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
Ccdc88bQ4QRL3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
Ccdc88bQ4QRL3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Ccdc88bQ4QRL3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Ccdc88bQ4QRL3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.52■■■■■ 5.2
Ccdc88bQ4QRL3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC47.51■■■■■ 5.2
Ccdc88bQ4QRL3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
Ccdc88bQ4QRL3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Ccdc88bQ4QRL3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
Ccdc88bQ4QRL3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Ccdc88bQ4QRL3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Ccdc88bQ4QRL3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
Ccdc88bQ4QRL3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms