Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRK1Q38SD2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRK1Q38SD2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRK1Q38SD2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRK1Q38SD2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRK1Q38SD2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRK1Q38SD2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRK1Q38SD2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRK1Q38SD2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRK1Q38SD2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRK1Q38SD2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRK1Q38SD2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRK1Q38SD2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRK1Q38SD2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRK1Q38SD2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRK1Q38SD2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LRRK1Q38SD2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRK1Q38SD2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LRRK1Q38SD2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LRRK1Q38SD2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LRRK1Q38SD2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LRRK1Q38SD2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRK1Q38SD2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRK1Q38SD2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRK1Q38SD2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRK1Q38SD2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRK1Q38SD2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LRRK1Q38SD2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LRRK1Q38SD2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRRK1Q38SD2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRK1Q38SD2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRK1Q38SD2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRK1Q38SD2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRK1Q38SD2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LRRK1Q38SD2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRK1Q38SD2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRK1Q38SD2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRK1Q38SD2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRK1Q38SD2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRK1Q38SD2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRK1Q38SD2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRK1Q38SD2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRK1Q38SD2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRK1Q38SD2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRK1Q38SD2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRK1Q38SD2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRK1Q38SD2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRK1Q38SD2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRK1Q38SD2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRK1Q38SD2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRK1Q38SD2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRK1Q38SD2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRK1Q38SD2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRK1Q38SD2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRK1Q38SD2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRK1Q38SD2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRK1Q38SD2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRK1Q38SD2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRK1Q38SD2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRK1Q38SD2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRK1Q38SD2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRK1Q38SD2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRK1Q38SD2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRK1Q38SD2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRK1Q38SD2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRK1Q38SD2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRK1Q38SD2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRK1Q38SD2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRK1Q38SD2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRK1Q38SD2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRK1Q38SD2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRK1Q38SD2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRK1Q38SD2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRK1Q38SD2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRK1Q38SD2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRK1Q38SD2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRK1Q38SD2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRK1Q38SD2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRK1Q38SD2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRK1Q38SD2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRK1Q38SD2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRK1Q38SD2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRK1Q38SD2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRK1Q38SD2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRK1Q38SD2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRK1Q38SD2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRK1Q38SD2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRK1Q38SD2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRK1Q38SD2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRK1Q38SD2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRK1Q38SD2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRK1Q38SD2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRK1Q38SD2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRK1Q38SD2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRK1Q38SD2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRK1Q38SD2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRK1Q38SD2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRK1Q38SD2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRK1Q38SD2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRK1Q38SD2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms