Protein: Q16630

CPSF6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6Q16630 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 154.9
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CPSF6Q16630 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.189e-8■■■■■ 140.4
CPSF6Q16630 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 112.2
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CPSF6Q16630 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 58.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 112.2
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CPSF6Q16630 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-20■■■■■ 87.9
CPSF6Q16630 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-20■■■■■ 87.9
CPSF6Q16630 ATG7-209ENST00000434066 553 ntTSL 58.89□□□□□ -0.991e-20■■■■■ 87.9
CPSF6Q16630 ATG7-207ENST00000424071 758 ntTSL 38.75□□□□□ -1.011e-20■■■■■ 87.9
CPSF6Q16630 ATG7-224ENST00000488924 570 ntTSL 47.23□□□□□ -1.251e-20■■■■■ 87.9
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CPSF6Q16630 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.081e-17■■■■■ 83.4
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CPSF6Q16630 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.688e-20■■■■■ 78.2
CPSF6Q16630 ARMC8-204ENST00000461822 2221 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.78e-20■■■■■ 78.2
CPSF6Q16630 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.718e-20■■■■■ 78.2
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CPSF6Q16630 ARMC8-202ENST00000460495 2189 ntTSL 27.64□□□□□ -1.198e-20■■■■■ 78.2
CPSF6Q16630 ARMC8-205ENST00000463485 1059 ntTSL 35.75□□□□□ -1.498e-20■■■■■ 78.2
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CPSF6Q16630 GALNT11-210ENST00000447778 1231 ntTSL 516.16■□□□□ 0.182e-14■■■■■ 67.4
CPSF6Q16630 GALNT11-209ENST00000446096 521 ntTSL 316■□□□□ 0.152e-14■■■■■ 67.4
CPSF6Q16630 GALNT11-204ENST00000423337 580 ntTSL 314.36□□□□□ -0.112e-14■■■■■ 67.4
CPSF6Q16630 GALNT11-206ENST00000431668 626 ntTSL 313.86□□□□□ -0.192e-14■■■■■ 67.4
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CPSF6Q16630 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 66.8
CPSF6Q16630 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 66.8
CPSF6Q16630 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 66.8
CPSF6Q16630 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.98□□□□□ -1.618e-10■■■■■ 61.9
CPSF6Q16630 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-10■■■■■ 61.3
CPSF6Q16630 ICMT-203ENST00000489498 2612 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-10■■■■■ 61.3
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CPSF6Q16630 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.323e-12■■■■■ 54.6
CPSF6Q16630 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-12■■■■■ 54.6
CPSF6Q16630 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 510.68□□□□□ -0.73e-12■■■■■ 54.6
CPSF6Q16630 TLK1-211ENST00000486857 715 ntTSL 39.14□□□□□ -0.953e-12■■■■■ 54.6
CPSF6Q16630 TLK1-207ENST00000453628 539 ntTSL 47.46□□□□□ -1.223e-12■■■■■ 54.6
CPSF6Q16630 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.683e-12■■■■■ 54.6
CPSF6Q16630 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.713e-12■■■■■ 54.6
CPSF6Q16630 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-48■■■■■ 54.4
CPSF6Q16630 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.926e-29■■■■■ 49.9
CPSF6Q16630 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.356e-29■■■■■ 49.9
CPSF6Q16630 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.456e-29■■■■■ 49.9
CPSF6Q16630 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.556e-29■■■■■ 49.9
CPSF6Q16630 ATF7IP2-215ENST00000568027 3406 ntTSL 1 (best)4.69□□□□□ -1.666e-29■■■■■ 49.9
CPSF6Q16630 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.756e-29■■■■■ 49.9
CPSF6Q16630 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 49.3
CPSF6Q16630 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 315.57■□□□□ 0.088e-12■■■■■ 49
CPSF6Q16630 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.048e-12■■■■■ 49
CPSF6Q16630 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.554e-8■■■■■ 48.9
CPSF6Q16630 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 212.6□□□□□ -0.396e-13■■■■■ 47
CPSF6Q16630 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 46.4
CPSF6Q16630 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.834e-8■■■■■ 46.4
CPSF6Q16630 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-12■■■■■ 46.2
CPSF6Q16630 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.138e-12■■■■■ 44.6
CPSF6Q16630 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.318e-12■■■■■ 44.6
CPSF6Q16630 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 44.3
CPSF6Q16630 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 44.3
CPSF6Q16630 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 44.3
CPSF6Q16630 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 518.55■□□□□ 0.563e-11■■■■■ 42.8
CPSF6Q16630 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.063e-11■■■■■ 42.8
CPSF6Q16630 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-11■■■■■ 42.8
CPSF6Q16630 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.213e-11■■■■■ 42.8
CPSF6Q16630 ANKHD1-218ENST00000506755 522 ntTSL 38.65□□□□□ -1.023e-11■■■■■ 42.8
CPSF6Q16630 ANKHD1-206ENST00000412116 1826 ntTSL 57.29□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 42.8
CPSF6Q16630 ANKHD1-201ENST00000246149 2062 ntTSL 27.23□□□□□ -1.253e-11■■■■■ 42.8
CPSF6Q16630 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.582e-11■■■■■ 42.5
CPSF6Q16630 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 42.4
CPSF6Q16630 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 42.4
CPSF6Q16630 BTBD1-204ENST00000559652 797 ntTSL 37.24□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 42.4
CPSF6Q16630 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 41.7
CPSF6Q16630 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 41.4
CPSF6Q16630 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 40.8
CPSF6Q16630 IWS1-203ENST00000412979 441 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 40
CPSF6Q16630 IWS1-212ENST00000637187 1021 ntTSL 56.38□□□□□ -1.391e-10■■■■■ 40
CPSF6Q16630 C14orf159-227ENST00000523576 860 ntTSL 313.88□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)13.22□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 211.37□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 510.59□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 39.5
CPSF6Q16630 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 512.82□□□□□ -0.367e-16■■■■■ 39.3
CPSF6Q16630 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 512.14□□□□□ -0.477e-16■■■■■ 39.3
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