Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-205ENST00000592094 1042 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.172e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.522e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-204ENST00000588654 541 ntTSL 410.99□□□□□ -0.652e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.692e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.082e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.094e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.234e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-205ENST00000373568 1037 ntTSL 511.84□□□□□ -0.514e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-216ENST00000470998 329 ntTSL 34.91□□□□□ -1.624e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.964e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.49□□□□□ -1.058e-41■■■■■ 213
SF3B4Q15427 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.168e-41■■■■■ 213
SF3B4Q15427 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.088e-41■■■■■ 213
SF3B4Q15427 ZDHHC8-207ENST00000472497 909 ntTSL 216.08■□□□□ 0.164e-68■■■■■ 210.2
SF3B4Q15427 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.154e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 RUVBL1-203ENST00000472125 913 ntTSL 39.77□□□□□ -0.854e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 RUVBL1-208ENST00000585057 1113 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.62□□□□□ -1.834e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 WDR74-208ENST00000538098 548 ntTSL 415.9■□□□□ 0.146e-130■■■■■ 189.4
SF3B4Q15427 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-130■■■■■ 189.4
SF3B4Q15427 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.086e-130■■■■■ 189.4
SF3B4Q15427 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC12.65□□□□□ -0.383e-34■■■■■ 160.9
SF3B4Q15427 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt10.01□□□□□ -0.813e-34■■■■■ 160.9
SF3B4Q15427 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt10□□□□□ -0.813e-34■■■■■ 160.9
SF3B4Q15427 SMPD4-220ENST00000491319 593 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-25■■■■■ 151.9
SF3B4Q15427 ZDHHC8-206ENST00000469212 625 ntTSL 313.2□□□□□ -0.33e-14■■■■■ 149.9
SF3B4Q15427 XAB2-203ENST00000596134 543 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 145.6
SF3B4Q15427 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-38■■■■■ 144.8
SF3B4Q15427 PLXNA3-205ENST00000482598 280 ntTSL 316.2■□□□□ 0.184e-39■■■■■ 140.6
SF3B4Q15427 SRSF1-203ENST00000581497 438 ntTSL 37.16□□□□□ -1.264e-66■■■■■ 131.8
SF3B4Q15427 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 38.34□□□□□ -1.076e-35■■■■■ 131.2
SF3B4Q15427 SMPD4-211ENST00000449159 635 ntTSL 59.51□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 130
SF3B4Q15427 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-11■■■■■ 127.1
SF3B4Q15427 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.216e-11■■■■■ 127.1
SF3B4Q15427 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 313.2□□□□□ -0.36e-11■■■■■ 127.1
SF3B4Q15427 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.376e-11■■■■■ 127.1
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-343ENST00000629339 870 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-304ENST00000626898 961 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-367ENST00000630975 931 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-353ENST00000629836 723 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-335ENST00000628883 891 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-328ENST00000628374 766 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-349ENST00000629533 1227 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-313ENST00000627327 1257 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-320ENST00000627918 1146 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-310ENST00000627181 1099 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-350ENST00000629603 874 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-333ENST00000628757 623 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-239ENST00000457076 542 ntTSL 48.92□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.042e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-326ENST00000628308 996 ntTSL 58.47□□□□□ -1.052e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-365ENST00000630746 932 ntTSL 58.37□□□□□ -1.072e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-318ENST00000627542 702 ntTSL 58.33□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-240ENST00000457770 547 ntTSL 48.32□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-288ENST00000626162 696 ntTSL 58.16□□□□□ -1.12e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-296ENST00000626574 887 ntTSL 57.93□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-272ENST00000625215 844 ntTSL 57.93□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-314ENST00000627398 922 ntTSL 57.71□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-297ENST00000626609 809 ntTSL 57.63□□□□□ -1.192e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-357ENST00000630214 1333 ntTSL 57.53□□□□□ -1.22e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.222e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-324ENST00000628263 755 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-276ENST00000625447 923 ntTSL 57.3□□□□□ -1.242e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.262e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-205ENST00000413791 743 ntTSL 27.1□□□□□ -1.272e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-330ENST00000628551 813 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-208ENST00000415742 564 ntTSL 46.98□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-345ENST00000629407 767 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-344ENST00000629374 676 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-212ENST00000418308 863 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.32e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-337ENST00000629084 761 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-308ENST00000627074 871 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-303ENST00000626842 741 ntTSL 56.75□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-340ENST00000629188 705 ntTSL 56.58□□□□□ -1.362e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-298ENST00000626632 708 ntTSL 56.53□□□□□ -1.362e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-369ENST00000631107 840 ntTSL 56.51□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-201ENST00000366234 884 ntTSL 56.25□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-218ENST00000421843 664 ntTSL 56.25□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-204ENST00000413436 602 ntTSL 45.97□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-226ENST00000434781 565 ntTSL 55.77□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-234ENST00000444320 809 ntTSL 55.76□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-216ENST00000420309 573 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-209ENST00000416068 555 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-238ENST00000456161 880 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-317ENST00000627540 662 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-257ENST00000601396 679 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-370ENST00000631110 851 ntTSL 55.72□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-332ENST00000628667 745 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-295ENST00000626558 699 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-245ENST00000594548 692 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-347ENST00000629485 784 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 1130.3 ms