Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 954.5
PCBP1Q15365 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 157.2
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PCBP1Q15365 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.35□□□□□ -0.432e-51■■■■■ 154.9
PCBP1Q15365 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.18□□□□□ -0.462e-51■■■■■ 154.9
PCBP1Q15365 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.26□□□□□ -1.254e-25■■■■■ 148.9
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PCBP1Q15365 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 216.41■□□□□ 0.227e-49■■■■■ 132.1
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PCBP1Q15365 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.258e-26■■■■■ 107.1
PCBP1Q15365 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.898e-26■■■■■ 107.1
PCBP1Q15365 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 37.68□□□□□ -1.188e-26■■■■■ 107.1
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PCBP1Q15365 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 214.7□□□□□ -0.064e-34■■■■■ 100.6
PCBP1Q15365 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.82e-12■■■■■ 98.1
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PCBP1Q15365 C19orf47-203ENST00000577617 550 ntTSL 316.05■□□□□ 0.162e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.741e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 315.12■□□□□ 0.011e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-205ENST00000572930 420 ntTSL 310.22□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.771e-323■■■■■ 96.9
PCBP1Q15365 GRINA-203ENST00000525513 796 ntTSL 517.39■□□□□ 0.374e-35■■■■■ 94.8
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PCBP1Q15365 GRINA-208ENST00000533044 564 ntTSL 310.51□□□□□ -0.734e-35■■■■■ 94.8
PCBP1Q15365 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.869e-14■■■■■ 93.4
PCBP1Q15365 OXA1L-204ENST00000431881 889 ntTSL 317.88■□□□□ 0.459e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.379e-12■■■■■ 92.4
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PCBP1Q15365 OXA1L-205ENST00000442110 691 ntTSL 516.27■□□□□ 0.29e-12■■■■■ 92.4
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PCBP1Q15365 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.059e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-208ENST00000483939 1224 ntTSL 214.91□□□□□ -0.029e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-209ENST00000495424 1679 ntTSL 213.59□□□□□ -0.239e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-206ENST00000473744 824 ntTSL 312.85□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-210ENST00000556473 593 ntTSL 411.96□□□□□ -0.499e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.699e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-207ENST00000481218 1596 ntTSL 58.88□□□□□ -0.999e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-15■■■■■ 90.5
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PCBP1Q15365 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 88
PCBP1Q15365 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-10■■■■■ 88
PCBP1Q15365 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.034e-13■■■■■ 85.6
PCBP1Q15365 G6PC3-202ENST00000585361 1572 ntTSL 219.57■□□□□ 0.724e-13■■■■■ 85.6
PCBP1Q15365 G6PC3-204ENST00000588558 1718 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.684e-13■■■■■ 85.6
PCBP1Q15365 G6PC3-205ENST00000590253 844 ntTSL 517.71■□□□□ 0.434e-13■■■■■ 85.6
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PCBP1Q15365 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.426e-9■■■■■ 84.5
PCBP1Q15365 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 84.4
PCBP1Q15365 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 322.7■■□□□ 1.222e-31■■■■■ 83.8
PCBP1Q15365 GRINA-206ENST00000530898 558 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-31■■■■■ 83.8
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PCBP1Q15365 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.63e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-12■■■■■ 83
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PCBP1Q15365 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.231e-6■■■■■ 81.9
PCBP1Q15365 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 81.5
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PCBP1Q15365 SLC37A4-220ENST00000638925 2046 ntTSL 514.62□□□□□ -0.079e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.179e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 514□□□□□ -0.179e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.189e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-210ENST00000527992 2040 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.249e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.549e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 414.71□□□□□ -0.054e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.214e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.44e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.964e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 27.89□□□□□ -1.154e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 513.61□□□□□ -0.231e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 513.08□□□□□ -0.321e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 56.64□□□□□ -1.351e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 MIEN1-204ENST00000498164 925 ntTSL 222.78■■□□□ 1.244e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-202ENST00000469568 825 ntTSL 222.78■■□□□ 1.244e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.924e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-206ENST00000582963 1999 nt20.24■□□□□ 0.834e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.674e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-203ENST00000474210 706 ntTSL 218.49■□□□□ 0.554e-14■■■■■ 80.1
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