Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.241e-323■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.231e-323■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PTCH2-202ENST00000438067 1110 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-323■■■■■ 30.2
EFTUD2Q15029 PTCH2-203ENST00000447098 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-323■■■■■ 30.2
EFTUD2Q15029 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.221e-323■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.41e-323■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.75□□□□□ -1.651e-323■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.821e-323■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.881e-323■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.941e-323■■■□□ 16.7
EFTUD2Q15029 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.951e-323■■■■■ 30.2
EFTUD2Q15029 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.021e-323■■■■□ 22.8
EFTUD2Q15029 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.061e-323■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.241e-323■■■■■ 60.6
EFTUD2Q15029 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.331e-323■■■■■ 33.6
EFTUD2Q15029 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.761e-323■■■■□ 21.1
EFTUD2Q15029 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.023e-175■■■■■ 568
EFTUD2Q15029 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 211.97□□□□□ -0.499e-88■■□□□ 13.6
EFTUD2Q15029 RBM39-234ENST00000487604 370 ntTSL 32.87□□□□□ -1.954e-85■■■■□ 22.4
EFTUD2Q15029 SKIV2L-211ENST00000485349 734 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-85■■■■■ 118.2
EFTUD2Q15029 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 317.67■□□□□ 0.425e-85■■■■□ 19.3
EFTUD2Q15029 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 317.19■□□□□ 0.341e-84■■■□□ 16.4
EFTUD2Q15029 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.932e-80■■■■□ 21.7
EFTUD2Q15029 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.642e-79■■■■□ 23.3
EFTUD2Q15029 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.027e-77■■■■■ 45.3
EFTUD2Q15029 ITIH3-209ENST00000493136 2179 ntTSL 214.35□□□□□ -0.111e-74■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ACTB-208ENST00000464611 715 ntTSL 58.74□□□□□ -1.017e-71■■■■□ 22.5
EFTUD2Q15029 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt16.66■□□□□ 0.261e-65■■■□□ 14.8
EFTUD2Q15029 APOA2-208ENST00000481413 927 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.23e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-206ENST00000469730 265 ntTSL 510.82□□□□□ -0.683e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-203ENST00000463812 401 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -13e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-202ENST00000463273 469 ntTSL 1 (best)8.63□□□□□ -1.033e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.523e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.643e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.13e-64■■■■□ 26.7
EFTUD2Q15029 APOA2-209ENST00000481511 655 ntTSL 511.7□□□□□ -0.544e-64■■■■□ 23.2
EFTUD2Q15029 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.914e-64■■■■□ 23.2
EFTUD2Q15029 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 36.1□□□□□ -1.434e-64■■■□□ 17.8
EFTUD2Q15029 GAS5-217ENST00000444470 424 ntTSL 25.28□□□□□ -1.564e-64■■■□□ 17.8
EFTUD2Q15029 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 25.28□□□□□ -1.564e-64■■■□□ 17.8
EFTUD2Q15029 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 21.81□□□□□ -2.124e-64■■■□□ 17.8
EFTUD2Q15029 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.53□□□□□ -21e-63■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 FASN-203ENST00000579410 424 ntTSL 29.38□□□□□ -0.915e-62■■■■□ 25.9
EFTUD2Q15029 WDR6-218ENST00000492780 537 ntTSL 213.56□□□□□ -0.246e-62■■■■■ 55.6
EFTUD2Q15029 SLC25A37-201ENST00000290075 1889 ntTSL 1 (best)21.69■■□□□ 1.069e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-202ENST00000417331 735 ntTSL 518.61■□□□□ 0.579e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-209ENST00000521637 503 ntTSL 317.97■□□□□ 0.479e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-210ENST00000522164 571 ntTSL 217.37■□□□□ 0.379e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.179e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-212ENST00000523930 823 ntTSL 515.59■□□□□ 0.099e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-204ENST00000518881 3404 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.029e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-211ENST00000523883 3651 ntTSL 210.63□□□□□ -0.719e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 SLC25A37-207ENST00000520654 3018 ntTSL 1 (best)9.73□□□□□ -0.859e-62■■□□□ 11.5
EFTUD2Q15029 PPP1R10-206ENST00000484449 605 ntTSL 54.21□□□□□ -1.745e-61■■■□□ 18.1
EFTUD2Q15029 PPP1R10-204ENST00000473954 470 ntTSL 33.38□□□□□ -1.875e-61■■■□□ 18.1
EFTUD2Q15029 ITIH3-210ENST00000495622 920 ntTSL 513.79□□□□□ -0.22e-60■■□□□ 12.9
EFTUD2Q15029 RPL38-205ENST00000530646 2450 ntTSL 1 (best)19.06■□□□□ 0.645e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 RPL38-203ENST00000528433 169 ntTSL 512.6□□□□□ -0.395e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 RPL38-204ENST00000529123 576 ntTSL 29.82□□□□□ -0.845e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.38e-57■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-219ENST00000542793 539 ntTSL 28.2□□□□□ -1.13e-56■■■■■ 29.6
EFTUD2Q15029 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-54■■■□□ 18
EFTUD2Q15029 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 210.01□□□□□ -0.811e-54■■■□□ 17.9
EFTUD2Q15029 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 34.82□□□□□ -1.641e-54■■■□□ 18
EFTUD2Q15029 SRRM2-224ENST00000575870 696 ntTSL 310.74□□□□□ -0.693e-54■■■□□ 19
EFTUD2Q15029 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 56.64□□□□□ -1.359e-54■■■□□ 18.9
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-242ENST00000522256 492 ntTSL 414.51□□□□□ -0.091e-53■■■■■ 33.1
EFTUD2Q15029 CD46-218ENST00000496723 661 ntTSL 53.19□□□□□ -1.93e-53■■■□□ 16
EFTUD2Q15029 WDR6-219ENST00000498023 626 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-50■■■■■ 55.6
EFTUD2Q15029 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.152e-50■■■□□ 15.2
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-226ENST00000515446 368 ntTSL 214.92□□□□□ -0.023e-50■■■■■ 65.3
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-221ENST00000513230 248 ntTSL 322.64■■□□□ 1.214e-50■■■■■ 80.1
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-48■■■■■ 60.8
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-249ENST00000524180 997 ntTSL 513.75□□□□□ -0.214e-48■■■■■ 60.8
EFTUD2Q15029 ALB-208ENST00000495173 445 ntTSL 36.29□□□□□ -1.43e-47■■□□□ 13
EFTUD2Q15029 ALB-213ENST00000508932 369 ntTSL 30.97□□□□□ -2.253e-47■■□□□ 13
EFTUD2Q15029 CDC20-204ENST00000482046 422 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-46■■■■■ 50.2
EFTUD2Q15029 SKIV2L-206ENST00000470453 455 ntTSL 314.65□□□□□ -0.062e-45■■■■■ 68.7
EFTUD2Q15029 SKIV2L-213ENST00000491994 866 ntTSL 214.37□□□□□ -0.112e-45■■■■■ 64.7
EFTUD2Q15029 SRSF2-211ENST00000592676 559 ntTSL 35.21□□□□□ -1.582e-45■■■■□ 22.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-207ENST00000537965 578 ntTSL 54.92□□□□□ -1.623e-45■■■■■ 30.8
EFTUD2Q15029 SNHG1-222ENST00000545308 646 ntTSL 23.52□□□□□ -1.853e-45■■■■■ 30.8
EFTUD2Q15029 ATXN2L-222ENST00000567024 525 ntTSL 316.88■□□□□ 0.295e-45■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SNHG1-215ENST00000540904 594 ntTSL 58.88□□□□□ -0.996e-45■■■■■ 32.6
EFTUD2Q15029 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.771e-44■■■□□ 15.9
EFTUD2Q15029 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 54.16□□□□□ -1.742e-44■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 SNHG1-202ENST00000535689 550 ntTSL 22.87□□□□□ -1.952e-44■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 53.34□□□□□ -1.872e-44■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.982e-44■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNHG1-225ENST00000545920 625 ntTSL 26.65□□□□□ -1.343e-44■■■■■ 56.1
EFTUD2Q15029 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 515.32■□□□□ 0.043e-44■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 RTKN-204ENST00000460968 842 ntTSL 213.72□□□□□ -0.211e-42■■■■□ 20.5
EFTUD2Q15029 HNRNPA2B1-207ENST00000495810 482 ntTSL 29.94□□□□□ -0.822e-42■■■□□ 16.1
EFTUD2Q15029 CCNL1-218ENST00000476744 1029 ntTSL 27.88□□□□□ -1.153e-42■■□□□ 12.2
EFTUD2Q15029 SRRM2-210ENST00000572721 841 ntTSL 213.16□□□□□ -0.34e-42■■■■■ 32.9
EFTUD2Q15029 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 38.28□□□□□ -1.085e-42■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC9.62□□□□□ -0.876e-42■■■□□ 18.3
EFTUD2Q15029 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 53.93□□□□□ -1.786e-42■■■□□ 18.3
EFTUD2Q15029 GK-212ENST00000488296 633 ntTSL 54.68□□□□□ -1.661e-41■■□□□ 12.5
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1169.5 ms