Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 57.9
TRA2AQ13595 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 57.9
TRA2AQ13595 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 57.6
TRA2AQ13595 NBPF15-203ENST00000577412 4707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-12■■■■■ 57.6
TRA2AQ13595 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.251e-12■■■■■ 57.6
TRA2AQ13595 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 TNRC6B-208ENST00000489500 564 ntTSL 28.78□□□□□ -14e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.34e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 35.91□□□□□ -1.464e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.654e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.654e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.674e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 24.64□□□□□ -1.674e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-210ENST00000497277 525 ntTSL 1 (best)3.54□□□□□ -1.844e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 53.47□□□□□ -1.854e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-205ENST00000469890 822 ntTSL 23.38□□□□□ -1.874e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-209ENST00000487736 508 ntTSL 52.14□□□□□ -2.074e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-11■■■■■ 56.8
TRA2AQ13595 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 514.63□□□□□ -0.072e-11■■■■■ 56.8
TRA2AQ13595 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.072e-11■■■■■ 56.8
TRA2AQ13595 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 56.8
TRA2AQ13595 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-15■■■■■ 56.1
TRA2AQ13595 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-15■■■■■ 56.1
TRA2AQ13595 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 211.87□□□□□ -0.514e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.784e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.814e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -14e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.024e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.054e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.064e-10■■■■■ 54.9
TRA2AQ13595 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-18■■■■■ 54.7
TRA2AQ13595 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-18■■■■■ 54.7
TRA2AQ13595 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 211.76□□□□□ -0.532e-18■■■■■ 54.7
TRA2AQ13595 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.272e-18■■■■■ 54.7
TRA2AQ13595 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.16e-24■■■■■ 54.5
TRA2AQ13595 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 53.9
TRA2AQ13595 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.675e-9■■■■■ 53.9
TRA2AQ13595 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.85e-9■■■■■ 53.9
TRA2AQ13595 SAFB2-202ENST00000585449 443 ntTSL 510.45□□□□□ -0.743e-11■■■■■ 53.6
TRA2AQ13595 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 34.34□□□□□ -1.713e-12■■■■■ 53.5
TRA2AQ13595 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.262e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 LUC7L2-205ENST00000463912 2382 ntTSL 25.69□□□□□ -1.52e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 LUC7L2-207ENST00000498518 2837 ntTSL 24.08□□□□□ -1.762e-9■■■■■ 52.5
TRA2AQ13595 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 33.03□□□□□ -1.929e-11■■■■■ 52
TRA2AQ13595 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.959e-11■■■■■ 52
TRA2AQ13595 SMC1A-204ENST00000463684 880 ntTSL 214.55□□□□□ -0.088e-12■■■■■ 51.5
TRA2AQ13595 SMC1A-203ENST00000428014 868 ntTSL 39.06□□□□□ -0.968e-12■■■■■ 51.5
TRA2AQ13595 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.968e-12■■■■■ 51.5
TRA2AQ13595 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.988e-12■■■■■ 51.5
TRA2AQ13595 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.438e-12■■■■■ 51.5
TRA2AQ13595 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.518e-12■■■■■ 51.5
TRA2AQ13595 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 26.19□□□□□ -1.426e-62■■■■■ 51.3
TRA2AQ13595 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 57.21□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 50.4
TRA2AQ13595 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.169e-12■■■■■ 50.3
TRA2AQ13595 HSP90AA1-205ENST00000555662 429 ntTSL 25.32□□□□□ -1.564e-15■■■■■ 49.7
TRA2AQ13595 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 49.7
TRA2AQ13595 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 49.7
TRA2AQ13595 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 49.7
TRA2AQ13595 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 49.7
TRA2AQ13595 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 49.7
TRA2AQ13595 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 56.03□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 49.7
TRA2AQ13595 CBX3-204ENST00000456948 1068 ntTSL 522.78■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 POLR3GL-203ENST00000471706 755 ntTSL 521.05■□□□□ 0.962e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.962e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 POLR3GL-204ENST00000622508 1600 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 DNTTIP2-203ENST00000460191 3084 ntTSL 213.03□□□□□ -0.322e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 CBX3-205ENST00000462165 949 ntTSL 310.89□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 DNTTIP2-201ENST00000359208 2199 ntTSL 27.3□□□□□ -1.242e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.592e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 CBX3-207ENST00000481300 559 ntTSL 23.28□□□□□ -1.882e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 CBX3-208ENST00000497498 922 ntTSL 22.58□□□□□ -22e-11■■■■■ 49.5
TRA2AQ13595 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.876e-8■■■■■ 48.4
TRA2AQ13595 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 48.4
TRA2AQ13595 RACK1-203ENST00000502844 1460 ntTSL 314.44□□□□□ -0.12e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 513.02□□□□□ -0.322e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-202ENST00000502548 1090 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.372e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-229ENST00000513027 697 ntTSL 311.62□□□□□ -0.552e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-223ENST00000510199 1100 ntTSL 311.46□□□□□ -0.572e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.812e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-204ENST00000502890 705 ntTSL 39.97□□□□□ -0.814e-30■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 59.74□□□□□ -0.852e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.852e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-212ENST00000505461 1005 ntTSL 59.65□□□□□ -0.862e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-234ENST00000515417 873 ntTSL 39.44□□□□□ -0.92e-50■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 39.26□□□□□ -0.934e-30■■■■■ 46.9
TRA2AQ13595 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 59.11□□□□□ -0.952e-50■■■■■ 46.9
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 271.4 ms