Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.224e-49■■■■■ 722.5
PABPC4Q13310 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)24.58■■□□□ 1.528e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 221.28■■□□□ 18e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 220.24■□□□□ 0.838e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.628e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 310.92□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 510.68□□□□□ -0.78e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.76□□□□□ -1.018e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 56.38□□□□□ -1.398e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 55.85□□□□□ -1.478e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.76□□□□□ -1.498e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.048e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 455.6
PABPC4Q13310 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 455.6
PABPC4Q13310 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 455.6
PABPC4Q13310 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.215e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 CALU-204ENST00000493278 589 ntTSL 35.72□□□□□ -1.495e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-323■■■■■ 323.7
PABPC4Q13310 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-42■■■■■ 318.1
PABPC4Q13310 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.169e-82■■■■■ 297.6
PABPC4Q13310 SLC26A5-215ENST00000487407 2098 ntTSL 226.78■■□□□ 1.887e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.577e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.557e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.027e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -07e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.087e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-204ENST00000356767 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.167e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-212ENST00000445809 2324 ntTSL 29.94□□□□□ -0.827e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-213ENST00000454864 2242 ntTSL 28.85□□□□□ -0.997e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.087e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-210ENST00000423416 2374 ntTSL 27.83□□□□□ -1.167e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.177e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.227e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-214ENST00000456463 2370 ntTSL 57□□□□□ -1.297e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.397e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.61e-323■■■■■ 271.1
PABPC4Q13310 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.351e-323■■■■■ 265.8
PABPC4Q13310 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.91e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.681e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC8.63□□□□□ -1.031e-68■■■■■ 237.7
PABPC4Q13310 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.945e-26■■■■■ 224.7
PABPC4Q13310 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.935e-26■■■■■ 224.7
PABPC4Q13310 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.865e-26■■■■■ 224.7
PABPC4Q13310 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 195
PABPC4Q13310 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 195
PABPC4Q13310 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 429.69■■■□□ 2.343e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.113e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 517.74■□□□□ 0.433e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.283e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-23■■■■■ 189.5
PABPC4Q13310 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-23■■■■■ 189.5
PABPC4Q13310 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.242e-23■■■■■ 189.5
PABPC4Q13310 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.863e-27■■■■■ 178
PABPC4Q13310 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.47e-52■■■■■ 172.4
PABPC4Q13310 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 165.9
PABPC4Q13310 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 165.9
PABPC4Q13310 HMCN1-204ENST00000485744 1884 ntTSL 211.89□□□□□ -0.512e-18■■■■■ 159.3
PABPC4Q13310 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.562e-18■■■■■ 159.3
PABPC4Q13310 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.151e-94■■■■■ 156.1
PABPC4Q13310 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-94■■■■■ 156.1
PABPC4Q13310 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-94■■■■■ 156.1
PABPC4Q13310 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 152.6
PABPC4Q13310 MIPEP-202ENST00000433710 494 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 152.6
PABPC4Q13310 MIPEP-203ENST00000464194 543 ntTSL 218.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 152.6
PABPC4Q13310 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-26■■■■■ 150.8
PABPC4Q13310 C17orf75-202ENST00000577809 1642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 C17orf75-201ENST00000225805 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 C17orf75-209ENST00000582961 458 ntTSL 57.13□□□□□ -1.272e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 C17orf75-210ENST00000583104 452 ntTSL 35.28□□□□□ -1.562e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.525e-17■■■■■ 141.5
PABPC4Q13310 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-17■■■■■ 137.3
PABPC4Q13310 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-17■■■■■ 137.3
PABPC4Q13310 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.2□□□□□ -1.589e-16■■■■■ 136.4
PABPC4Q13310 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-16■■■■■ 134.9
PABPC4Q13310 RAE1-207ENST00000462438 3251 ntTSL 213.89□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.558e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.218e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.318e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-207ENST00000528759 3278 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.648e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.828e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.948e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.91e-10■■■■■ 123
PABPC4Q13310 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.713e-28■■■■■ 119.5
PABPC4Q13310 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 118.2
PABPC4Q13310 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.281e-13■■■■■ 116.7
PABPC4Q13310 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 115.8
PABPC4Q13310 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 115.3
PABPC4Q13310 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 115.3
PABPC4Q13310 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 516.27■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 115.3
PABPC4Q13310 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-11■■■■■ 114.2
PABPC4Q13310 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 114.2
PABPC4Q13310 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-11■■■■■ 114.2
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 610.2 ms