Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC62.81■■■■■ 7.65
HMGXB3Q12766 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC62.55■■■■■ 7.6
HMGXB3Q12766 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC62■■■■■ 7.52
HMGXB3Q12766 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.26■■■■■ 7.4
HMGXB3Q12766 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.49■■■■■ 7.27
HMGXB3Q12766 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.88■■■■■ 7.18
HMGXB3Q12766 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.87■■■■■ 7.17
HMGXB3Q12766 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.85■■■■■ 7.17
HMGXB3Q12766 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC59.81■■■■■ 7.17
HMGXB3Q12766 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC59.54■■■■■ 7.12
HMGXB3Q12766 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC59.44■■■■■ 7.11
HMGXB3Q12766 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.43■■■■■ 7.1
HMGXB3Q12766 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC59.31■■■■■ 7.09
HMGXB3Q12766 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.25■■■■■ 7.08
HMGXB3Q12766 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC59.18■■■■■ 7.06
HMGXB3Q12766 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.96■■■■■ 7.03
HMGXB3Q12766 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.41■■■■■ 6.94
HMGXB3Q12766 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC58.35■■■■■ 6.93
HMGXB3Q12766 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC58.34■■■■■ 6.93
HMGXB3Q12766 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.99■■■■■ 6.87
HMGXB3Q12766 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.98■■■■■ 6.87
HMGXB3Q12766 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC57.98■■■■■ 6.87
HMGXB3Q12766 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC57.96■■■■■ 6.87
HMGXB3Q12766 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC57.81■■■■■ 6.85
HMGXB3Q12766 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.76■■■■■ 6.84
HMGXB3Q12766 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.6■■■■■ 6.81
HMGXB3Q12766 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC57.41■■■■■ 6.78
HMGXB3Q12766 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC57.4■■■■■ 6.78
HMGXB3Q12766 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC57.37■■■■■ 6.77
HMGXB3Q12766 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.36■■■■■ 6.77
HMGXB3Q12766 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC57.25■■■■■ 6.75
HMGXB3Q12766 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC56.82■■■■■ 6.69
HMGXB3Q12766 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.75■■■■■ 6.68
HMGXB3Q12766 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC56.7■■■■■ 6.67
HMGXB3Q12766 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.68■■■■■ 6.66
HMGXB3Q12766 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC56.54■■■■■ 6.64
HMGXB3Q12766 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC56.37■■■■■ 6.61
HMGXB3Q12766 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC56.24■■■■■ 6.59
HMGXB3Q12766 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC56.07■■■■■ 6.57
HMGXB3Q12766 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC56.01■■■■■ 6.56
HMGXB3Q12766 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.99■■■■■ 6.55
HMGXB3Q12766 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC55.63■■■■■ 6.5
HMGXB3Q12766 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.59■■■■■ 6.49
HMGXB3Q12766 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.59■■■■■ 6.49
HMGXB3Q12766 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC55.55■■■■■ 6.48
HMGXB3Q12766 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC55.51■■■■■ 6.48
HMGXB3Q12766 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.38■■■■■ 6.46
HMGXB3Q12766 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC55.3■■■■■ 6.44
HMGXB3Q12766 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.28■■■■■ 6.44
HMGXB3Q12766 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.26■■■■■ 6.44
HMGXB3Q12766 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC55.26■■■■■ 6.44
HMGXB3Q12766 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC55.24■■■■■ 6.43
HMGXB3Q12766 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC55.24■■■■■ 6.43
HMGXB3Q12766 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC55.23■■■■■ 6.43
HMGXB3Q12766 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC55.23■■■■■ 6.43
HMGXB3Q12766 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC55.09■■■■■ 6.41
HMGXB3Q12766 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC55.06■■■■■ 6.41
HMGXB3Q12766 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
HMGXB3Q12766 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
HMGXB3Q12766 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.92■■■■■ 6.38
HMGXB3Q12766 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.86■■■■■ 6.37
HMGXB3Q12766 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.84■■■■■ 6.37
HMGXB3Q12766 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.8■■■■■ 6.36
HMGXB3Q12766 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
HMGXB3Q12766 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.7■■■■■ 6.35
HMGXB3Q12766 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC54.62■■■■■ 6.33
HMGXB3Q12766 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC54.57■■■■■ 6.33
HMGXB3Q12766 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC54.57■■■■■ 6.33
HMGXB3Q12766 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC54.53■■■■■ 6.32
HMGXB3Q12766 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
HMGXB3Q12766 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
HMGXB3Q12766 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.35■■■■■ 6.29
HMGXB3Q12766 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC54.34■■■■■ 6.29
HMGXB3Q12766 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
HMGXB3Q12766 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.24■■■■■ 6.27
HMGXB3Q12766 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC54.24■■■■■ 6.27
HMGXB3Q12766 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.22■■■■■ 6.27
HMGXB3Q12766 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC54.22■■■■■ 6.27
HMGXB3Q12766 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
HMGXB3Q12766 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.25
HMGXB3Q12766 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
HMGXB3Q12766 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC54.09■■■■■ 6.25
HMGXB3Q12766 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
HMGXB3Q12766 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC54.04■■■■■ 6.24
HMGXB3Q12766 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC54.03■■■■■ 6.24
HMGXB3Q12766 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
HMGXB3Q12766 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
HMGXB3Q12766 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC53.89■■■■■ 6.22
HMGXB3Q12766 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC53.88■■■■■ 6.22
HMGXB3Q12766 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC53.88■■■■■ 6.22
HMGXB3Q12766 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC53.88■■■■■ 6.22
HMGXB3Q12766 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.87■■■■■ 6.21
HMGXB3Q12766 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.87■■■■■ 6.21
HMGXB3Q12766 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC53.83■■■■■ 6.21
HMGXB3Q12766 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC53.83■■■■■ 6.21
HMGXB3Q12766 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.83■■■■■ 6.21
HMGXB3Q12766 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC53.79■■■■■ 6.2
HMGXB3Q12766 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.76■■■■■ 6.2
HMGXB3Q12766 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC53.74■■■■■ 6.19
HMGXB3Q12766 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms