Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 NSR1YGR159C 1245 nt17.63■□□□□ 0.41
USB1Q12208 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.59■□□□□ 0.41
USB1Q12208 NOP1YDL014W 984 nt17.14■□□□□ 0.33
USB1Q12208 MDJ1YFL016C 1536 nt15.69■□□□□ 0.1
USB1Q12208 YKL036CYKL036C 393 nt15.62■□□□□ 0.09
USB1Q12208 SRX1YKL086W 384 nt14.9□□□□□ -0.02
USB1Q12208 Q0297Q0297 156 nt14.88□□□□□ -0.03
USB1Q12208 YJL027CYJL027C 417 nt14.57□□□□□ -0.08
USB1Q12208 YCR051WYCR051W 669 nt14.14□□□□□ -0.15
USB1Q12208 SCS3YGL126W 1143 nt14.08□□□□□ -0.16
USB1Q12208 DBP2YNL112W 1641 nt13.8□□□□□ -0.2
USB1Q12208 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.52□□□□□ -0.25
USB1Q12208 YBR190WYBR190W 312 nt13.5□□□□□ -0.25
USB1Q12208 YOL085CYOL085C 342 nt13.49□□□□□ -0.25
USB1Q12208 CCC1YLR220W 969 nt13.4□□□□□ -0.26
USB1Q12208 RPP1BYDL130W 321 nt13.36□□□□□ -0.27
USB1Q12208 PKP1YIL042C 1185 nt13.28□□□□□ -0.28
USB1Q12208 RTC3YHR087W 336 nt13.21□□□□□ -0.29
USB1Q12208 RVS167YDR388W 1449 nt13.12□□□□□ -0.31
USB1Q12208 SCJ1YMR214W 1134 nt12.84□□□□□ -0.35
USB1Q12208 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.76□□□□□ -0.37
USB1Q12208 PET122YER153C 765 nt12.73□□□□□ -0.37
USB1Q12208 SCR1SCR1 522 nt12.67□□□□□ -0.38
USB1Q12208 ATS1YAL020C 1002 nt12.6□□□□□ -0.39
USB1Q12208 SHR5YOL110W 714 nt12.56□□□□□ -0.4
USB1Q12208 YDJ1YNL064C 1230 nt12.38□□□□□ -0.43
USB1Q12208 RRN5YLR141W 1092 nt12.36□□□□□ -0.43
USB1Q12208 PUT4YOR348C 1884 nt12.28□□□□□ -0.44
USB1Q12208 URN1YPR152C 1398 nt12.28□□□□□ -0.44
USB1Q12208 DEP1YAL013W 1218 nt12.2□□□□□ -0.46
USB1Q12208 RPN10YHR200W 807 nt12.16□□□□□ -0.46
USB1Q12208 OPI9YLR338W 858 nt12.13□□□□□ -0.47
USB1Q12208 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.12□□□□□ -0.47
USB1Q12208 RSB1YOR049C 1065 nt12.11□□□□□ -0.47
USB1Q12208 GAR1YHR089C 618 nt12.1□□□□□ -0.47
USB1Q12208 YNL208WYNL208W 600 nt12.07□□□□□ -0.48
USB1Q12208 SAH1YER043C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
USB1Q12208 ARE1YCR048W 1833 nt12.02□□□□□ -0.49
USB1Q12208 POA1YBR022W 534 nt11.91□□□□□ -0.5
USB1Q12208 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.89□□□□□ -0.51
USB1Q12208 SSA3YBL075C 1950 nt11.83□□□□□ -0.52
USB1Q12208 PUN1YLR414C 792 nt11.82□□□□□ -0.52
USB1Q12208 YJR018WYJR018W 363 nt11.72□□□□□ -0.53
USB1Q12208 TIR1YER011W 765 nt11.7□□□□□ -0.54
USB1Q12208 PST2YDR032C 597 nt11.67□□□□□ -0.54
USB1Q12208 BSC6YOL137W 1494 nt11.67□□□□□ -0.54
USB1Q12208 PTC2YER089C 1395 nt11.66□□□□□ -0.54
USB1Q12208 BUD23YCR047C 828 nt11.64□□□□□ -0.55
USB1Q12208 NAB2YGL122C 1578 nt11.55□□□□□ -0.56
USB1Q12208 SSA1YAL005C 1929 nt11.54□□□□□ -0.56
USB1Q12208 RPP2BYDR382W 333 nt11.52□□□□□ -0.57
USB1Q12208 YJR120WYJR120W 351 nt11.38□□□□□ -0.59
USB1Q12208 DAL1YIR027C 1383 nt11.37□□□□□ -0.59
USB1Q12208 INM2YDR287W 879 nt11.36□□□□□ -0.59
USB1Q12208 FPR4YLR449W 1179 nt11.34□□□□□ -0.59
USB1Q12208 FIS1YIL065C 468 nt11.29□□□□□ -0.6
USB1Q12208 YKL097CYKL097C 411 nt11.24□□□□□ -0.61
USB1Q12208 PHO4YFR034C 939 nt11.23□□□□□ -0.61
USB1Q12208 SRB2YHR041C 633 nt11.21□□□□□ -0.61
USB1Q12208 BDH2YAL061W 1254 nt11.2□□□□□ -0.62
USB1Q12208 SHU1YHL006C 453 nt11.19□□□□□ -0.62
USB1Q12208 YBL100CYBL100C 315 nt11.19□□□□□ -0.62
USB1Q12208 SPT5YML010W 3192 nt11.12□□□□□ -0.63
USB1Q12208 WWM1YFL010C 636 nt11.12□□□□□ -0.63
USB1Q12208 YGR021WYGR021W 873 nt11.12□□□□□ -0.63
USB1Q12208 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.05□□□□□ -0.64
USB1Q12208 YPS1YLR120C 1710 nt11.05□□□□□ -0.64
USB1Q12208 LSM3YLR438C-A 270 nt11.05□□□□□ -0.64
USB1Q12208 TRM9YML014W 840 nt11.05□□□□□ -0.64
USB1Q12208 FUN26YAL022C 1554 nt11.04□□□□□ -0.64
USB1Q12208 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.02□□□□□ -0.65
USB1Q12208 HOM6YJR139C 1080 nt10.99□□□□□ -0.65
USB1Q12208 MEP2YNL142W 1500 nt10.99□□□□□ -0.65
USB1Q12208 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.98□□□□□ -0.65
USB1Q12208 ALF1YNL148C 765 nt10.98□□□□□ -0.65
USB1Q12208 YDR095CYDR095C 411 nt10.96□□□□□ -0.65
USB1Q12208 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.9□□□□□ -0.66
USB1Q12208 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.9□□□□□ -0.66
USB1Q12208 CCT6YDR188W 1641 nt10.9□□□□□ -0.66
USB1Q12208 MNP1YGL068W 585 nt10.88□□□□□ -0.67
USB1Q12208 RKM5YLR137W 1104 nt10.84□□□□□ -0.67
USB1Q12208 SSA4YER103W 1929 nt10.84□□□□□ -0.67
USB1Q12208 RPP2AYOL039W 321 nt10.79□□□□□ -0.68
USB1Q12208 SIS1YNL007C 1059 nt10.75□□□□□ -0.69
USB1Q12208 DCW1YKL046C 1350 nt10.75□□□□□ -0.69
USB1Q12208 YOL037CYOL037C 354 nt10.74□□□□□ -0.69
USB1Q12208 YOR139CYOR139C 393 nt10.74□□□□□ -0.69
USB1Q12208 NPL3YDR432W 1245 nt10.72□□□□□ -0.69
USB1Q12208 YMR090WYMR090W 684 nt10.72□□□□□ -0.69
USB1Q12208 EMI2YDR516C 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
USB1Q12208 PTP1YDL230W 1008 nt10.66□□□□□ -0.7
USB1Q12208 CAC2YML102W 1407 nt10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.1 ms