Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 CHTF18-203ENST00000426047 790 ntTSL 316.44■□□□□ 0.223e-25■■■■■ 75.1
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SRSF1Q07955 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 513.97□□□□□ -0.173e-25■■■■■ 75.1
SRSF1Q07955 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 211.9□□□□□ -0.59e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.639e-9■■■■■ 73.5
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SRSF1Q07955 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 210.72□□□□□ -0.699e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.729e-9■■■■■ 73.5
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SRSF1Q07955 HERPUD1-207ENST00000563781 774 ntTSL 34.58□□□□□ -1.685e-17■■■■■ 53
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SRSF1Q07955 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 51.6
SRSF1Q07955 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.22e-11■■■■■ 50.7
SRSF1Q07955 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.712e-11■■■■■ 50.7
SRSF1Q07955 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.872e-11■■■■■ 50.7
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SRSF1Q07955 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.666e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 58.53□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 FKBP9P1-201ENST00000441699 1491 ntBASIC10.87□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 46.7
SRSF1Q07955 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 34.12□□□□□ -1.755e-10■■■■■ 46.4
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SRSF1Q07955 PUM1-219ENST00000527498 652 ntTSL 33.78□□□□□ -1.82e-12■■■■■ 42.5
SRSF1Q07955 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 213.49□□□□□ -0.257e-12■■■■■ 41.5
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SRSF1Q07955 HERPUD1-208ENST00000563911 844 ntTSL 35.93□□□□□ -1.469e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 HERPUD1-209ENST00000564678 2199 ntTSL 1 (best)5.52□□□□□ -1.539e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 HERPUD1-213ENST00000568358 751 ntTSL 54.47□□□□□ -1.699e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.539e-10■■■■■ 40.6
SRSF1Q07955 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.929e-10■■■■■ 40.6
SRSF1Q07955 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.385e-13■■■■■ 40.5
SRSF1Q07955 DDX17-210ENST00000497196 856 ntTSL 38.03□□□□□ -1.126e-32■■■■■ 40.5
SRSF1Q07955 PHF1-208ENST00000486845 1099 ntTSL 520.05■□□□□ 0.89e-13■■■■■ 39.9
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SRSF1Q07955 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 215.41■□□□□ 0.065e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.035e-13■■■■■ 39.6
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SRSF1Q07955 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.635e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.685e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 29.05□□□□□ -0.965e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-208ENST00000438912 473 ntTSL 54.03□□□□□ -1.765e-13■■■■■ 39.6
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SRSF1Q07955 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 38.3
SRSF1Q07955 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.731e-9■■■■■ 38.3
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SRSF1Q07955 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 38.2
SRSF1Q07955 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.545e-10■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.755e-10■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.525e-10■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 ANP32B-203ENST00000486769 400 ntTSL 210.9□□□□□ -0.661e-53■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.411e-13■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 PTRH2-201ENST00000393038 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 PTRH2-202ENST00000409433 2246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 PTRH2-204ENST00000579915 531 ntTSL 45.24□□□□□ -1.572e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 PTRH2-205ENST00000587935 409 ntTSL 34.35□□□□□ -1.712e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 IST1-222ENST00000545388 630 ntTSL 210.77□□□□□ -0.695e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 IST1-214ENST00000538709 491 ntTSL 210.29□□□□□ -0.765e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 IST1-210ENST00000537571 603 ntTSL 25.02□□□□□ -1.615e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 DDB2-216ENST00000622878 556 ntTSL 415.21■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-215ENST00000622090 580 ntTSL 513.16□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 37.2
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SRSF1Q07955 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 311.04□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-205ENST00000610805 793 ntTSL 510.91□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 210.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-210ENST00000615695 897 ntTSL 29.83□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 27.05□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 37.2
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SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-217ENST00000449305 748 ntTSL 212.89□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-214ENST00000445076 620 ntTSL 29.26□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-201ENST00000411670 675 ntTSL 58.25□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-216ENST00000447577 431 ntTSL 57.73□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-220ENST00000452347 969 ntTSL 27.28□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 37.1
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