Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Thbs3Q05895 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Thbs3Q05895 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Thbs3Q05895 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Thbs3Q05895 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Thbs3Q05895 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Thbs3Q05895 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Thbs3Q05895 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Thbs3Q05895 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Thbs3Q05895 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Thbs3Q05895 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Thbs3Q05895 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Thbs3Q05895 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Thbs3Q05895 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Thbs3Q05895 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Thbs3Q05895 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thbs3Q05895 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Thbs3Q05895 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Thbs3Q05895 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Thbs3Q05895 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Thbs3Q05895 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Thbs3Q05895 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Thbs3Q05895 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Thbs3Q05895 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Thbs3Q05895 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Thbs3Q05895 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thbs3Q05895 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Thbs3Q05895 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thbs3Q05895 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Thbs3Q05895 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thbs3Q05895 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thbs3Q05895 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Thbs3Q05895 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Thbs3Q05895 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Thbs3Q05895 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Thbs3Q05895 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thbs3Q05895 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thbs3Q05895 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thbs3Q05895 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thbs3Q05895 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thbs3Q05895 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Thbs3Q05895 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Thbs3Q05895 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Thbs3Q05895 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Thbs3Q05895 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Thbs3Q05895 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Thbs3Q05895 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Thbs3Q05895 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Thbs3Q05895 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thbs3Q05895 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thbs3Q05895 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thbs3Q05895 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thbs3Q05895 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thbs3Q05895 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Thbs3Q05895 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Thbs3Q05895 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thbs3Q05895 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thbs3Q05895 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Thbs3Q05895 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thbs3Q05895 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Thbs3Q05895 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thbs3Q05895 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thbs3Q05895 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thbs3Q05895 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thbs3Q05895 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thbs3Q05895 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Thbs3Q05895 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thbs3Q05895 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thbs3Q05895 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thbs3Q05895 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thbs3Q05895 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thbs3Q05895 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Thbs3Q05895 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Thbs3Q05895 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Thbs3Q05895 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Thbs3Q05895 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thbs3Q05895 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thbs3Q05895 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thbs3Q05895 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thbs3Q05895 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thbs3Q05895 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thbs3Q05895 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thbs3Q05895 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thbs3Q05895 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Thbs3Q05895 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thbs3Q05895 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thbs3Q05895 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thbs3Q05895 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Thbs3Q05895 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thbs3Q05895 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thbs3Q05895 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thbs3Q05895 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thbs3Q05895 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thbs3Q05895 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thbs3Q05895 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thbs3Q05895 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thbs3Q05895 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thbs3Q05895 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thbs3Q05895 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thbs3Q05895 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms