Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM3P62310 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM3P62310 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM3P62310 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM3P62310 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM3P62310 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM3P62310 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM3P62310 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM3P62310 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM3P62310 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM3P62310 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM3P62310 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM3P62310 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LSM3P62310 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM3P62310 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM3P62310 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM3P62310 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM3P62310 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM3P62310 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM3P62310 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSM3P62310 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSM3P62310 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM3P62310 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM3P62310 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM3P62310 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM3P62310 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM3P62310 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM3P62310 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM3P62310 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM3P62310 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM3P62310 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM3P62310 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM3P62310 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSM3P62310 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM3P62310 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSM3P62310 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSM3P62310 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM3P62310 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM3P62310 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM3P62310 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM3P62310 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM3P62310 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM3P62310 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM3P62310 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM3P62310 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM3P62310 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM3P62310 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM3P62310 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM3P62310 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSM3P62310 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM3P62310 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM3P62310 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM3P62310 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM3P62310 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM3P62310 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM3P62310 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM3P62310 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM3P62310 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM3P62310 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM3P62310 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM3P62310 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM3P62310 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM3P62310 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM3P62310 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM3P62310 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM3P62310 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSM3P62310 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM3P62310 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM3P62310 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM3P62310 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM3P62310 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSM3P62310 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM3P62310 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM3P62310 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM3P62310 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM3P62310 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM3P62310 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM3P62310 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM3P62310 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM3P62310 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM3P62310 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM3P62310 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM3P62310 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM3P62310 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM3P62310 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM3P62310 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM3P62310 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM3P62310 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM3P62310 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM3P62310 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM3P62310 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM3P62310 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM3P62310 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM3P62310 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM3P62310 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM3P62310 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM3P62310 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM3P62310 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM3P62310 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM3P62310 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms