Protein: P62280

RPS11, 40S ribosomal protein S11, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS11P62280 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-205ENST00000597371 1081 ntTSL 317.75■□□□□ 0.436e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-208ENST00000495367 567 ntTSL 316■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 38.4
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RPS11P62280 C19orf60-203ENST00000595077 2465 nt13.15□□□□□ -0.36e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-6■■■■■ 38.4
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RPS11P62280 UNC13D-215ENST00000591563 4382 ntTSL 211.11□□□□□ -0.636e-6■■■■■ 38.4
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RPS11P62280 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 25.3
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RPS11P62280 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-6■■■■□ 25.3
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RPS11P62280 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 25.3
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RPS11P62280 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 24.2
RPS11P62280 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 24
RPS11P62280 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 23.8
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RPS11P62280 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 31.87□□□□□ -2.112e-6■■■■□ 23.8
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RPS11P62280 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-19■■■■□ 23
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RPS11P62280 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.19e-14■■■■□ 22.2
RPS11P62280 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 21.6
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RPS11P62280 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 26.38□□□□□ -1.394e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 NRDC-203ENST00000440943 1660 ntTSL 56.09□□□□□ -1.434e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.524e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 319.27■□□□□ 0.688e-9■■■■□ 20.6
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RPS11P62280 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.098e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-9■■■■□ 20.6
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RPS11P62280 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 212.22□□□□□ -0.458e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.548e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 518.07■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.9
RPS11P62280 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 17.9
RPS11P62280 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.545e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.265e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.375e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.45e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.425e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.445e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.535e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-203ENST00000535520 1626 ntTSL 25.19□□□□□ -1.585e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-217ENST00000543809 1667 ntTSL 1 (best)4.18□□□□□ -1.745e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.895e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-213ENST00000542801 502 ntTSL 43.11□□□□□ -1.915e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-210ENST00000540401 1439 ntTSL 1 (best)2.09□□□□□ -2.075e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 17.4
RPS11P62280 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.921e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.841e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 56.25□□□□□ -1.411e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-207ENST00000510681 536 ntTSL 43.03□□□□□ -1.921e-323■■■□□ 17.3
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