Protein: P62280

RPS11, 40S ribosomal protein S11, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS11P62280 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.638e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 216.77■□□□□ 0.288e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 216.09■□□□□ 0.178e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.628e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.888e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 57.63□□□□□ -1.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 37.63□□□□□ -1.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.22□□□□□ -1.258e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 42.27□□□□□ -2.058e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.43□□□□□ -2.188e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 51.23□□□□□ -2.218e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.348e-17■■■■■ 578.9
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RPS11P62280 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-12■■■■■ 95
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RPS11P62280 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt9.47□□□□□ -0.891e-35■■■■■ 95
RPS11P62280 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)18.5■□□□□ 0.557e-11■■■■■ 82.3
RPS11P62280 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 47.32□□□□□ -1.242e-12■■■■■ 81.6
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RPS11P62280 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.737e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.137e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 NHSL2-205ENST00000631833 452 ntTSL 512.01□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 69.7
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RPS11P62280 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 69.7
RPS11P62280 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.093e-9■■■■■ 69.7
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RPS11P62280 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 68.3
RPS11P62280 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 63.3
RPS11P62280 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 63.3
RPS11P62280 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 63.3
RPS11P62280 KCNQ1-205ENST00000496887 582 ntTSL 513.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 63.3
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RPS11P62280 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.248e-9■■■■■ 57.6
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RPS11P62280 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC7.25□□□□□ -1.253e-19■■■■■ 52.8
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RPS11P62280 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.59e-7■■■■■ 50.7
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RPS11P62280 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 48
RPS11P62280 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 46.6
RPS11P62280 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 46.6
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RPS11P62280 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.86e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.856e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.876e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.936e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.036e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.086e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.546e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 34.76□□□□□ -1.656e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-204ENST00000448812 774 ntTSL 58.42□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-209ENST00000486017 764 ntTSL 34.88□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-211ENST00000492373 552 ntTSL 43.52□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.166e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.316e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 SLC29A4-205ENST00000439491 805 ntTSL 311.92□□□□□ -0.56e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 C19orf60-206ENST00000598375 1792 ntTSL 520.13■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-207ENST00000600997 2275 ntTSL 218.95■□□□□ 0.626e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 38.4
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