Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC62.38■■■■■ 7.58
Cux1P53564 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57.92■■■■■ 6.86
Cux1P53564 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
Cux1P53564 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.41■■■■■ 6.3
Cux1P53564 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.24■■■■■ 6.27
Cux1P53564 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.22■■■■■ 6.11
Cux1P53564 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.69■■■■■ 6.03
Cux1P53564 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
Cux1P53564 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
Cux1P53564 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
Cux1P53564 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.93■■■■■ 5.9
Cux1P53564 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
Cux1P53564 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.77
Cux1P53564 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.65■■■■■ 5.7
Cux1P53564 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
Cux1P53564 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.34■■■■■ 5.65
Cux1P53564 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.13■■■■■ 5.62
Cux1P53564 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.04■■■■■ 5.6
Cux1P53564 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
Cux1P53564 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49.87■■■■■ 5.57
Cux1P53564 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
Cux1P53564 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
Cux1P53564 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49.44■■■■■ 5.5
Cux1P53564 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Cux1P53564 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Cux1P53564 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Cux1P53564 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
Cux1P53564 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
Cux1P53564 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
Cux1P53564 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.42
Cux1P53564 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
Cux1P53564 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
Cux1P53564 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.62■■■■■ 5.37
Cux1P53564 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.36■■■■■ 5.33
Cux1P53564 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Cux1P53564 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Cux1P53564 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Cux1P53564 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.88■■■■■ 5.26
Cux1P53564 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Cux1P53564 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
Cux1P53564 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.64■■■■■ 5.22
Cux1P53564 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Cux1P53564 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.55■■■■■ 5.2
Cux1P53564 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
Cux1P53564 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
Cux1P53564 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Cux1P53564 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.18■■■■■ 5.14
Cux1P53564 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
Cux1P53564 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Cux1P53564 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Cux1P53564 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
Cux1P53564 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
Cux1P53564 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
Cux1P53564 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
Cux1P53564 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
Cux1P53564 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
Cux1P53564 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
Cux1P53564 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Cux1P53564 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.41■■■■■ 5.02
Cux1P53564 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Cux1P53564 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
Cux1P53564 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Cux1P53564 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Cux1P53564 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Cux1P53564 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Cux1P53564 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.13■■■■■ 4.97
Cux1P53564 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.12■■■■■ 4.97
Cux1P53564 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
Cux1P53564 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Cux1P53564 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Cux1P53564 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Cux1P53564 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Cux1P53564 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Cux1P53564 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.93
Cux1P53564 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Cux1P53564 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Cux1P53564 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
Cux1P53564 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Cux1P53564 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Cux1P53564 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Cux1P53564 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
Cux1P53564 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Cux1P53564 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Cux1P53564 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Cux1P53564 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Cux1P53564 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Cux1P53564 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
Cux1P53564 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Cux1P53564 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Cux1P53564 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Cux1P53564 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Cux1P53564 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Cux1P53564 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Cux1P53564 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Cux1P53564 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
Cux1P53564 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Cux1P53564 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Cux1P53564 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Cux1P53564 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Cux1P53564 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms