Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Srp9P49962 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Srp9P49962 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srp9P49962 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srp9P49962 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Srp9P49962 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Srp9P49962 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srp9P49962 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Srp9P49962 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Srp9P49962 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Srp9P49962 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srp9P49962 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Srp9P49962 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srp9P49962 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srp9P49962 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Srp9P49962 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srp9P49962 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srp9P49962 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srp9P49962 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Srp9P49962 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srp9P49962 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srp9P49962 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp9P49962 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srp9P49962 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srp9P49962 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srp9P49962 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Srp9P49962 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srp9P49962 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srp9P49962 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srp9P49962 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srp9P49962 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srp9P49962 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srp9P49962 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srp9P49962 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srp9P49962 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp9P49962 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srp9P49962 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srp9P49962 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srp9P49962 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srp9P49962 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srp9P49962 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srp9P49962 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp9P49962 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srp9P49962 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srp9P49962 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srp9P49962 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp9P49962 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp9P49962 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Srp9P49962 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Srp9P49962 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp9P49962 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srp9P49962 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srp9P49962 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srp9P49962 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srp9P49962 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp9P49962 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srp9P49962 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp9P49962 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srp9P49962 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srp9P49962 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srp9P49962 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srp9P49962 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srp9P49962 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srp9P49962 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp9P49962 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srp9P49962 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp9P49962 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp9P49962 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp9P49962 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp9P49962 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srp9P49962 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp9P49962 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srp9P49962 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srp9P49962 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srp9P49962 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srp9P49962 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srp9P49962 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp9P49962 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp9P49962 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp9P49962 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp9P49962 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp9P49962 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp9P49962 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp9P49962 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp9P49962 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp9P49962 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srp9P49962 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srp9P49962 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srp9P49962 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp9P49962 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srp9P49962 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srp9P49962 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srp9P49962 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms