Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
HTTP42858 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.92
HTTP42858 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
HTTP42858 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HTTP42858 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HTTP42858 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HTTP42858 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HTTP42858 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
HTTP42858 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HTTP42858 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HTTP42858 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HTTP42858 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HTTP42858 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HTTP42858 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HTTP42858 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
HTTP42858 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
HTTP42858 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HTTP42858 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
HTTP42858 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HTTP42858 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
HTTP42858 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HTTP42858 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HTTP42858 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HTTP42858 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
HTTP42858 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HTTP42858 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HTTP42858 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
HTTP42858 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HTTP42858 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HTTP42858 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HTTP42858 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HTTP42858 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HTTP42858 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
HTTP42858 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
HTTP42858 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HTTP42858 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HTTP42858 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
HTTP42858 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HTTP42858 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HTTP42858 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HTTP42858 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HTTP42858 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HTTP42858 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HTTP42858 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HTTP42858 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HTTP42858 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HTTP42858 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HTTP42858 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HTTP42858 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HTTP42858 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HTTP42858 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HTTP42858 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HTTP42858 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HTTP42858 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HTTP42858 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HTTP42858 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HTTP42858 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HTTP42858 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HTTP42858 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HTTP42858 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HTTP42858 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HTTP42858 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HTTP42858 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HTTP42858 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HTTP42858 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HTTP42858 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HTTP42858 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HTTP42858 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HTTP42858 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HTTP42858 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HTTP42858 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HTTP42858 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HTTP42858 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HTTP42858 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HTTP42858 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
HTTP42858 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HTTP42858 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HTTP42858 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HTTP42858 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HTTP42858 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HTTP42858 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HTTP42858 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HTTP42858 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HTTP42858 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HTTP42858 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HTTP42858 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HTTP42858 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HTTP42858 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HTTP42858 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HTTP42858 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HTTP42858 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HTTP42858 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HTTP42858 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HTTP42858 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HTTP42858 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HTTP42858 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HTTP42858 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HTTP42858 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HTTP42858 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HTTP42858 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms