Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC63.82■■■■■ 7.81
Chd1P40201 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.7■■■■■ 7.15
Chd1P40201 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.22■■■■■ 6.91
Chd1P40201 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56■■■■■ 6.55
Chd1P40201 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.9■■■■■ 6.38
Chd1P40201 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
Chd1P40201 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.85■■■■■ 6.21
Chd1P40201 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.84■■■■■ 6.21
Chd1P40201 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
Chd1P40201 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
Chd1P40201 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.06■■■■■ 6.08
Chd1P40201 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.43■■■■■ 5.98
Chd1P40201 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
Chd1P40201 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.81■■■■■ 5.88
Chd1P40201 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51.79■■■■■ 5.88
Chd1P40201 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
Chd1P40201 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
Chd1P40201 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
Chd1P40201 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
Chd1P40201 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
Chd1P40201 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
Chd1P40201 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.51■■■■■ 5.68
Chd1P40201 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.7■■■■■ 5.55
Chd1P40201 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
Chd1P40201 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Chd1P40201 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
Chd1P40201 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.25■■■■■ 5.47
Chd1P40201 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
Chd1P40201 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48.85■■■■■ 5.41
Chd1P40201 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
Chd1P40201 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.78■■■■■ 5.4
Chd1P40201 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
Chd1P40201 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Chd1P40201 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.49■■■■■ 5.35
Chd1P40201 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
Chd1P40201 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
Chd1P40201 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
Chd1P40201 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
Chd1P40201 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
Chd1P40201 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
Chd1P40201 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
Chd1P40201 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
Chd1P40201 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Chd1P40201 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.04■■■■■ 5.28
Chd1P40201 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.94■■■■■ 5.27
Chd1P40201 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
Chd1P40201 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.88■■■■■ 5.26
Chd1P40201 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Chd1P40201 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
Chd1P40201 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
Chd1P40201 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Chd1P40201 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Chd1P40201 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
Chd1P40201 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Chd1P40201 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Chd1P40201 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
Chd1P40201 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Chd1P40201 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
Chd1P40201 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.09
Chd1P40201 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Chd1P40201 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Chd1P40201 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Chd1P40201 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Chd1P40201 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
Chd1P40201 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
Chd1P40201 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Chd1P40201 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Chd1P40201 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
Chd1P40201 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Chd1P40201 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Chd1P40201 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
Chd1P40201 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Chd1P40201 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Chd1P40201 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
Chd1P40201 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Chd1P40201 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Chd1P40201 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Chd1P40201 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
Chd1P40201 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Chd1P40201 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
Chd1P40201 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
Chd1P40201 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
Chd1P40201 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
Chd1P40201 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Chd1P40201 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
Chd1P40201 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Chd1P40201 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Chd1P40201 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Chd1P40201 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Chd1P40201 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Chd1P40201 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
Chd1P40201 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Chd1P40201 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.19■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms