Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GDNFP39905 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDNFP39905 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GDNFP39905 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GDNFP39905 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDNFP39905 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDNFP39905 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDNFP39905 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDNFP39905 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDNFP39905 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDNFP39905 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDNFP39905 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDNFP39905 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GDNFP39905 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GDNFP39905 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDNFP39905 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDNFP39905 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDNFP39905 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDNFP39905 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDNFP39905 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDNFP39905 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDNFP39905 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDNFP39905 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDNFP39905 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDNFP39905 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDNFP39905 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDNFP39905 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDNFP39905 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GDNFP39905 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDNFP39905 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDNFP39905 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDNFP39905 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDNFP39905 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDNFP39905 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDNFP39905 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDNFP39905 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDNFP39905 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDNFP39905 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDNFP39905 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDNFP39905 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDNFP39905 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDNFP39905 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDNFP39905 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDNFP39905 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GDNFP39905 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDNFP39905 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDNFP39905 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDNFP39905 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDNFP39905 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDNFP39905 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDNFP39905 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDNFP39905 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDNFP39905 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDNFP39905 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDNFP39905 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDNFP39905 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDNFP39905 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDNFP39905 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDNFP39905 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDNFP39905 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDNFP39905 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDNFP39905 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDNFP39905 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDNFP39905 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDNFP39905 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDNFP39905 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDNFP39905 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDNFP39905 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDNFP39905 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDNFP39905 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDNFP39905 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDNFP39905 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDNFP39905 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDNFP39905 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDNFP39905 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDNFP39905 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDNFP39905 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDNFP39905 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDNFP39905 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDNFP39905 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDNFP39905 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDNFP39905 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDNFP39905 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDNFP39905 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDNFP39905 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDNFP39905 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDNFP39905 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDNFP39905 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDNFP39905 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDNFP39905 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDNFP39905 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDNFP39905 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDNFP39905 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDNFP39905 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDNFP39905 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDNFP39905 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDNFP39905 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDNFP39905 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDNFP39905 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDNFP39905 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms