Protein: P39880

CUX1, Homeobox protein cut-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1P39880 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC59.29■■■■■ 7.08
CUX1P39880 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.83■■■■■ 7.01
CUX1P39880 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC58.01■■■■■ 6.88
CUX1P39880 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.88■■■■■ 6.86
CUX1P39880 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.34■■■■■ 6.77
CUX1P39880 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.95■■■■■ 6.71
CUX1P39880 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.66■■■■■ 6.66
CUX1P39880 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.49■■■■■ 6.63
CUX1P39880 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.23■■■■■ 6.59
CUX1P39880 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC56.05■■■■■ 6.56
CUX1P39880 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.94■■■■■ 6.55
CUX1P39880 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC55.94■■■■■ 6.55
CUX1P39880 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.86■■■■■ 6.53
CUX1P39880 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
CUX1P39880 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.28■■■■■ 6.44
CUX1P39880 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.23■■■■■ 6.43
CUX1P39880 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.22■■■■■ 6.43
CUX1P39880 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
CUX1P39880 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
CUX1P39880 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC54.49■■■■■ 6.31
CUX1P39880 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
CUX1P39880 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
CUX1P39880 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.42■■■■■ 6.3
CUX1P39880 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.3■■■■■ 6.28
CUX1P39880 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
CUX1P39880 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC54.27■■■■■ 6.28
CUX1P39880 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.17■■■■■ 6.26
CUX1P39880 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
CUX1P39880 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.06■■■■■ 6.24
CUX1P39880 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC54.04■■■■■ 6.24
CUX1P39880 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.89■■■■■ 6.22
CUX1P39880 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC53.71■■■■■ 6.19
CUX1P39880 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC53.57■■■■■ 6.17
CUX1P39880 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.53■■■■■ 6.16
CUX1P39880 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.53■■■■■ 6.16
CUX1P39880 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC53.22■■■■■ 6.11
CUX1P39880 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
CUX1P39880 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC53.12■■■■■ 6.09
CUX1P39880 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.98■■■■■ 6.07
CUX1P39880 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.83■■■■■ 6.05
CUX1P39880 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.68■■■■■ 6.02
CUX1P39880 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
CUX1P39880 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
CUX1P39880 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
CUX1P39880 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.32■■■■■ 5.97
CUX1P39880 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
CUX1P39880 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC52.15■■■■■ 5.94
CUX1P39880 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
CUX1P39880 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
CUX1P39880 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
CUX1P39880 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.89■■■■■ 5.9
CUX1P39880 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
CUX1P39880 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.88■■■■■ 5.9
CUX1P39880 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
CUX1P39880 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
CUX1P39880 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.74■■■■■ 5.87
CUX1P39880 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC51.74■■■■■ 5.87
CUX1P39880 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
CUX1P39880 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
CUX1P39880 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.63■■■■■ 5.86
CUX1P39880 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.62■■■■■ 5.85
CUX1P39880 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
CUX1P39880 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.59■■■■■ 5.85
CUX1P39880 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
CUX1P39880 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
CUX1P39880 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
CUX1P39880 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.27■■■■■ 5.8
CUX1P39880 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
CUX1P39880 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
CUX1P39880 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
CUX1P39880 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.8
CUX1P39880 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
CUX1P39880 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
CUX1P39880 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
CUX1P39880 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
CUX1P39880 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
CUX1P39880 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
CUX1P39880 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
CUX1P39880 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.02■■■■■ 5.76
CUX1P39880 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC51.02■■■■■ 5.76
CUX1P39880 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.99■■■■■ 5.75
CUX1P39880 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CUX1P39880 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
CUX1P39880 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.85■■■■■ 5.73
CUX1P39880 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
CUX1P39880 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.82■■■■■ 5.73
CUX1P39880 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
CUX1P39880 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
CUX1P39880 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.69■■■■■ 5.71
CUX1P39880 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.67■■■■■ 5.7
CUX1P39880 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC50.64■■■■■ 5.7
CUX1P39880 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
CUX1P39880 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
CUX1P39880 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
CUX1P39880 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
CUX1P39880 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
CUX1P39880 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.45■■■■■ 5.67
CUX1P39880 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.44■■■■■ 5.67
CUX1P39880 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
CUX1P39880 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.43■■■■■ 5.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms