Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SCN4AP35499 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SCN4AP35499 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SCN4AP35499 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SCN4AP35499 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SCN4AP35499 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SCN4AP35499 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SCN4AP35499 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCN4AP35499 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SCN4AP35499 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SCN4AP35499 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SCN4AP35499 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SCN4AP35499 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SCN4AP35499 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SCN4AP35499 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
SCN4AP35499 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
SCN4AP35499 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SCN4AP35499 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SCN4AP35499 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SCN4AP35499 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SCN4AP35499 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SCN4AP35499 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SCN4AP35499 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SCN4AP35499 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SCN4AP35499 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCN4AP35499 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCN4AP35499 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
SCN4AP35499 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SCN4AP35499 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SCN4AP35499 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCN4AP35499 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SCN4AP35499 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCN4AP35499 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCN4AP35499 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
SCN4AP35499 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCN4AP35499 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCN4AP35499 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SCN4AP35499 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
SCN4AP35499 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCN4AP35499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCN4AP35499 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCN4AP35499 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCN4AP35499 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCN4AP35499 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SCN4AP35499 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SCN4AP35499 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCN4AP35499 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCN4AP35499 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCN4AP35499 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCN4AP35499 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SCN4AP35499 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SCN4AP35499 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SCN4AP35499 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCN4AP35499 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCN4AP35499 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCN4AP35499 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCN4AP35499 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCN4AP35499 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SCN4AP35499 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCN4AP35499 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCN4AP35499 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCN4AP35499 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCN4AP35499 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCN4AP35499 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SCN4AP35499 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SCN4AP35499 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCN4AP35499 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCN4AP35499 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCN4AP35499 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCN4AP35499 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SCN4AP35499 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCN4AP35499 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCN4AP35499 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCN4AP35499 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCN4AP35499 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SCN4AP35499 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCN4AP35499 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCN4AP35499 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCN4AP35499 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCN4AP35499 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCN4AP35499 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCN4AP35499 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCN4AP35499 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCN4AP35499 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCN4AP35499 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCN4AP35499 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCN4AP35499 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCN4AP35499 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCN4AP35499 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCN4AP35499 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCN4AP35499 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCN4AP35499 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms