Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXD11P31277 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXD11P31277 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXD11P31277 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXD11P31277 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXD11P31277 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXD11P31277 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXD11P31277 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms