Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HOXD11P31277 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HOXD11P31277 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HOXD11P31277 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HOXD11P31277 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HOXD11P31277 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HOXD11P31277 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
HOXD11P31277 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HOXD11P31277 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HOXD11P31277 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HOXD11P31277 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HOXD11P31277 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HOXD11P31277 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
HOXD11P31277 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXD11P31277 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXD11P31277 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXD11P31277 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXD11P31277 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
HOXD11P31277 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HOXD11P31277 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXD11P31277 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXD11P31277 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HOXD11P31277 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXD11P31277 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXD11P31277 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HOXD11P31277 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXD11P31277 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXD11P31277 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXD11P31277 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HOXD11P31277 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
HOXD11P31277 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HOXD11P31277 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXD11P31277 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXD11P31277 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HOXD11P31277 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXD11P31277 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXD11P31277 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXD11P31277 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXD11P31277 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXD11P31277 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXD11P31277 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXD11P31277 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXD11P31277 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HOXD11P31277 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HOXD11P31277 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXD11P31277 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXD11P31277 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXD11P31277 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HOXD11P31277 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXD11P31277 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXD11P31277 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXD11P31277 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXD11P31277 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXD11P31277 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXD11P31277 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXD11P31277 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXD11P31277 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXD11P31277 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXD11P31277 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXD11P31277 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXD11P31277 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXD11P31277 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXD11P31277 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXD11P31277 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HOXD11P31277 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HOXD11P31277 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HOXD11P31277 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXD11P31277 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXD11P31277 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXD11P31277 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXD11P31277 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HOXD11P31277 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXD11P31277 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXD11P31277 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXD11P31277 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms