Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD3P31249 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD3P31249 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD3P31249 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD3P31249 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD3P31249 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD3P31249 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD3P31249 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD3P31249 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD3P31249 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD3P31249 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD3P31249 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD3P31249 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD3P31249 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD3P31249 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD3P31249 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD3P31249 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD3P31249 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD3P31249 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD3P31249 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD3P31249 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD3P31249 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD3P31249 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD3P31249 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD3P31249 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD3P31249 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD3P31249 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD3P31249 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD3P31249 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD3P31249 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD3P31249 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD3P31249 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD3P31249 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD3P31249 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD3P31249 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD3P31249 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD3P31249 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD3P31249 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD3P31249 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD3P31249 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD3P31249 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD3P31249 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD3P31249 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD3P31249 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD3P31249 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD3P31249 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD3P31249 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD3P31249 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD3P31249 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD3P31249 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD3P31249 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD3P31249 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD3P31249 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD3P31249 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD3P31249 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD3P31249 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD3P31249 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD3P31249 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD3P31249 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD3P31249 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD3P31249 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD3P31249 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD3P31249 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD3P31249 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD3P31249 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD3P31249 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD3P31249 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD3P31249 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD3P31249 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD3P31249 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD3P31249 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD3P31249 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD3P31249 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD3P31249 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD3P31249 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD3P31249 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD3P31249 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD3P31249 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD3P31249 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD3P31249 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD3P31249 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD3P31249 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD3P31249 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD3P31249 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD3P31249 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD3P31249 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD3P31249 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD3P31249 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD3P31249 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD3P31249 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD3P31249 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD3P31249 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD3P31249 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms