Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.49■■■■■ 5.99
PTPRMP28827 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.98■■■■■ 5.91
PTPRMP28827 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.55■■■■■ 5.84
PTPRMP28827 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
PTPRMP28827 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
PTPRMP28827 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
PTPRMP28827 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
PTPRMP28827 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
PTPRMP28827 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.01■■■■■ 5.6
PTPRMP28827 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
PTPRMP28827 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.54■■■■■ 5.52
PTPRMP28827 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
PTPRMP28827 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.38■■■■■ 5.5
PTPRMP28827 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
PTPRMP28827 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
PTPRMP28827 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.01■■■■■ 5.44
PTPRMP28827 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
PTPRMP28827 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
PTPRMP28827 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
PTPRMP28827 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.45■■■■■ 5.35
PTPRMP28827 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.42■■■■■ 5.34
PTPRMP28827 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
PTPRMP28827 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
PTPRMP28827 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
PTPRMP28827 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
PTPRMP28827 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
PTPRMP28827 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
PTPRMP28827 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
PTPRMP28827 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.97■■■■■ 5.27
PTPRMP28827 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
PTPRMP28827 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
PTPRMP28827 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
PTPRMP28827 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
PTPRMP28827 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
PTPRMP28827 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
PTPRMP28827 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
PTPRMP28827 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.13■■■■■ 5.13
PTPRMP28827 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
PTPRMP28827 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
PTPRMP28827 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
PTPRMP28827 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
PTPRMP28827 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
PTPRMP28827 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
PTPRMP28827 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.49■■■■■ 5.03
PTPRMP28827 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
PTPRMP28827 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
PTPRMP28827 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
PTPRMP28827 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
PTPRMP28827 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.31■■■■■ 5
PTPRMP28827 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
PTPRMP28827 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
PTPRMP28827 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
PTPRMP28827 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
PTPRMP28827 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.12■■■■■ 4.97
PTPRMP28827 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
PTPRMP28827 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
PTPRMP28827 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
PTPRMP28827 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
PTPRMP28827 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
PTPRMP28827 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
PTPRMP28827 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
PTPRMP28827 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
PTPRMP28827 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
PTPRMP28827 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
PTPRMP28827 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
PTPRMP28827 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
PTPRMP28827 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
PTPRMP28827 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
PTPRMP28827 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
PTPRMP28827 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
PTPRMP28827 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
PTPRMP28827 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
PTPRMP28827 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
PTPRMP28827 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
PTPRMP28827 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
PTPRMP28827 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
PTPRMP28827 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
PTPRMP28827 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
PTPRMP28827 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
PTPRMP28827 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
PTPRMP28827 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
PTPRMP28827 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
PTPRMP28827 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
PTPRMP28827 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
PTPRMP28827 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
PTPRMP28827 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
PTPRMP28827 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
PTPRMP28827 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
PTPRMP28827 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
PTPRMP28827 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
PTPRMP28827 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
PTPRMP28827 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
PTPRMP28827 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
PTPRMP28827 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
PTPRMP28827 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
PTPRMP28827 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
PTPRMP28827 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
PTPRMP28827 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
PTPRMP28827 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
PTPRMP28827 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms