Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.598e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.68e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-203ENST00000538956 1264 ntTSL 211.2□□□□□ -0.628e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.658e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.678e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-203ENST00000380154 1624 ntTSL 210.84□□□□□ -0.678e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-207ENST00000493905 1358 ntTSL 510.78□□□□□ -0.688e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TFF3-203ENST00000489676 419 ntTSL 210.78□□□□□ -0.688e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 510.76□□□□□ -0.698e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-209ENST00000620074 1058 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.698e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-204ENST00000479445 793 ntTSL 210.68□□□□□ -0.78e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 CPT1A-204ENST00000538994 617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 DGAT2-205ENST00000603865 2678 ntTSL 210.63□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 STIM1-205ENST00000526156 1024 ntTSL 210.6□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 STIM1-206ENST00000526596 1214 ntTSL 510.53□□□□□ -0.728e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.738e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 DGAT2-204ENST00000603363 5926 ntTSL 210.5□□□□□ -0.738e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ACO2-206ENST00000481310 330 ntTSL 310.49□□□□□ -0.738e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.748e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAN2B1-202ENST00000433513 560 ntTSL 410.4□□□□□ -0.748e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.758e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALAD-208ENST00000482847 3247 ntTSL 210.26□□□□□ -0.778e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.798e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.828e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-201ENST00000218516 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.838e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GTF3C1-206ENST00000566779 645 ntTSL 39.74□□□□□ -0.858e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.868e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ST6GALNAC4-204ENST00000474282 384 ntTSL 39.52□□□□□ -0.898e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PTDSS1-205ENST00000518776 766 ntTSL 39.52□□□□□ -0.898e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-211ENST00000628474 3701 ntTSL 59.41□□□□□ -0.98e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-207ENST00000615729 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-202ENST00000341403 1202 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-206ENST00000613013 528 ntTSL 28.93□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-210ENST00000620706 654 ntTSL 38.93□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GATB-207ENST00000510720 874 ntTSL 38.75□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 38.22□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-206ENST00000555245 1531 ntTSL 27.6□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAN2B1-215ENST00000596591 340 ntTSL 57.58□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-205ENST00000480513 612 ntTSL 37.4□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALG5-205ENST00000496689 756 ntTSL 57.11□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ROBO1-211ENST00000498428 3566 ntTSL 26.91□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.428e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C5-203ENST00000466280 540 ntTSL 55.97□□□□□ -1.458e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-206ENST00000486121 723 ntTSL 35.62□□□□□ -1.518e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 NUP188-203ENST00000465344 400 ntTSL 55.45□□□□□ -1.548e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ANAPC16-203ENST00000478193 734 ntTSL 212.85□□□□□ -0.358e-6■■□□□ 12.7
RPS3P23396 ANAPC16-205ENST00000621663 3567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.688e-6■■□□□ 12.7
RPS3P23396 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.688e-6■■□□□ 12.7
RPS3P23396 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.98e-6■■□□□ 12.7
RPS3P23396 ANAPC16-202ENST00000470481 1828 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -18e-6■■□□□ 12.7
RPS3P23396 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.448e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.398e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 MCM4-210ENST00000520934 621 ntTSL 323.35■■□□□ 1.338e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.288e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 RAD51-204ENST00000525066 1545 ntTSL 522.39■■□□□ 1.178e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.078e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 IPO11-207ENST00000505902 530 ntTSL 419.49■□□□□ 0.718e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.638e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 318.94■□□□□ 0.628e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.68e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.588e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KAT5-214ENST00000534104 576 ntTSL 418.56■□□□□ 0.568e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 218.22■□□□□ 0.518e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.438e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.398e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.288e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.288e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.268e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 ANO10-211ENST00000444344 575 ntTSL 316.15■□□□□ 0.188e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 TUBB2A-202ENST00000489942 817 ntTSL 216.02■□□□□ 0.168e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 DHX9-206ENST00000483416 814 ntTSL 516.01■□□□□ 0.158e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KAT5-211ENST00000532042 763 ntTSL 215.91■□□□□ 0.148e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.118e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.068e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.038e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 ANO10-208ENST00000428831 641 ntTSL 515.19■□□□□ 0.028e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.018e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 ARL1-204ENST00000548070 590 ntTSL 414.9□□□□□ -0.028e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 FKBP4-206ENST00000543769 425 ntTSL 514.66□□□□□ -0.068e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.118e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 ARL1-208ENST00000551092 731 ntTSL 513.74□□□□□ -0.218e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.218e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 DRC3-206ENST00000490517 5805 ntTSL 213.72□□□□□ -0.218e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 ABCE1-202ENST00000502586 786 ntTSL 513.6□□□□□ -0.238e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.288e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 KAT5-206ENST00000527544 745 ntTSL 213.25□□□□□ -0.298e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.328e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 HDAC1-203ENST00000463172 895 ntTSL 212.71□□□□□ -0.378e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 HDAC1-207ENST00000481281 721 ntTSL 512.68□□□□□ -0.388e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 ANO10-214ENST00000456438 545 ntTSL 412.19□□□□□ -0.468e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 MCM4-216ENST00000524086 547 ntTSL 512.12□□□□□ -0.478e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.478e-6■■□□□ 12.6
RPS3P23396 SRP54-206ENST00000555317 644 ntTSL 211.8□□□□□ -0.528e-6■■□□□ 12.6
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