Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 GDAP1-204ENST00000521096 806 ntTSL 311.55□□□□□ -0.564e-115■■■■■ 753.4
RPS3P23396 GDAP1-203ENST00000520797 735 ntTSL 37.85□□□□□ -1.154e-115■■■■■ 753.4
RPS3P23396 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.037e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 218.82■□□□□ 0.67e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 217.98■□□□□ 0.477e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.437e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.077e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.397e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.817e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.91□□□□□ -0.987e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.91□□□□□ -0.987e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.9□□□□□ -1.147e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 41.57□□□□□ -2.167e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 5-0.04□□□□□ -2.427e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 5-0.16□□□□□ -2.447e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.477e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 200
RPS3P23396 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 192.4
RPS3P23396 TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 840 ntTSL 315.46■□□□□ 0.072e-15■■■■■ 159.5
RPS3P23396 PNPLA4-201ENST00000381042 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 PNPLA4-202ENST00000442940 652 ntTSL 29.11□□□□□ -0.951e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.461e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 RPSA-208ENST00000487876 572 ntTSL 412.51□□□□□ -0.414e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 210.78□□□□□ -0.684e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-206ENST00000477325 596 ntTSL 28.77□□□□□ -1.014e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.264e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-205ENST00000475346 622 ntTSL 1 (best)2.9□□□□□ -1.954e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 DAD1-202ENST00000489532 339 ntTSL 31.92□□□□□ -2.12e-17■■■■■ 116.3
RPS3P23396 AHCYL1-204ENST00000469401 575 ntTSL 29.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 106.8
RPS3P23396 AHCYL1-206ENST00000481423 732 ntTSL 31.93□□□□□ -2.11e-7■■■■■ 106.8
RPS3P23396 HIST1H4C-201ENST00000377803 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-40■■■■■ 98.6
RPS3P23396 IL12RB1-204ENST00000594176 557 ntTSL 414.65□□□□□ -0.061e-27■■■■■ 96.1
RPS3P23396 IL12RB1-206ENST00000598019 595 ntTSL 413.49□□□□□ -0.251e-27■■■■■ 96.1
RPS3P23396 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-27■■■■■ 96.1
RPS3P23396 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.021e-13■■■■■ 91.2
RPS3P23396 CA9-203ENST00000493245 697 ntTSL 510.24□□□□□ -0.772e-17■■■■■ 90.5
RPS3P23396 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.881e-12■■■■■ 84.1
RPS3P23396 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.073e-37■■■■■ 82.4
RPS3P23396 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.023e-37■■■■■ 82.4
RPS3P23396 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.853e-37■■■■■ 82.4
RPS3P23396 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.714e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 GALNT16-203ENST00000553471 5548 ntTSL 515.31■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.034e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-204ENST00000567745 1218 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.344e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.414e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-203ENST00000357769 3403 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.924e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-37■■■■■ 79.3
RPS3P23396 TBL3-204ENST00000567615 1047 ntTSL 216.26■□□□□ 0.192e-20■■■■■ 78.1
RPS3P23396 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.321e-323■■■■■ 77
RPS3P23396 UCP2-204ENST00000539764 464 ntTSL 33.92□□□□□ -1.785e-13■■■■■ 75.9
RPS3P23396 POLR2L-202ENST00000534030 585 ntTSL 418.58■□□□□ 0.568e-13■■■■■ 74.5
RPS3P23396 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.298e-13■■■■■ 74.5
RPS3P23396 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 73.4
RPS3P23396 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 73.1
RPS3P23396 NDUFB9-203ENST00000517830 320 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 71.9
RPS3P23396 PEPD-206ENST00000589598 596 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-13■■■■■ 71.8
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RPS3P23396 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 70.8
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RPS3P23396 MT1G-201ENST00000379811 405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.744e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MRPS9-202ENST00000413583 652 ntTSL 39.05□□□□□ -0.961e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MT1G-202ENST00000444837 406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.074e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.091e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MRPS30-203ENST00000508129 560 ntTSL 21.52□□□□□ -2.171e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.924e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 28.79□□□□□ -14e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.875e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-209ENST00000536911 855 ntTSL 39.13□□□□□ -0.955e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -15e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-206ENST00000535530 576 ntTSL 48.67□□□□□ -1.025e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-207ENST00000536629 570 ntTSL 48.11□□□□□ -1.115e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.135e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.375e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-201ENST00000367206 1816 ntTSL 26.5□□□□□ -1.375e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 RPL9-209ENST00000511075 1028 ntTSL 24.94□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 67.1
RPS3P23396 RPL9-202ENST00000437992 579 ntTSL 43.11□□□□□ -1.913e-7■■■■■ 67.1
RPS3P23396 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-9■■■■■ 66.8
RPS3P23396 ERO1A-204ENST00000554251 555 ntTSL 515.73■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 66.6
RPS3P23396 ERO1A-207ENST00000556223 567 ntTSL 415.73■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 66.6
RPS3P23396 SRRT-204ENST00000448764 1607 ntTSL 516.86■□□□□ 0.298e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.088e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-210ENST00000477529 540 ntTSL 213.72□□□□□ -0.218e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.528e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-211ENST00000478693 655 ntTSL 211.16□□□□□ -0.628e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.718e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-203ENST00000445337 446 ntTSL 36.21□□□□□ -1.428e-10■■■■■ 65.9
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