Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.465e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.335e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.245e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 513.49□□□□□ -0.255e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 512.86□□□□□ -0.355e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 412.37□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 512.02□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.979e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.289e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 LAMA5-214ENST00000497363 579 ntTSL 318.44■□□□□ 0.549e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.359e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-209ENST00000511545 608 ntTSL 212.72□□□□□ -0.379e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-208ENST00000511211 566 ntTSL 38.55□□□□□ -1.049e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.159e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.249e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-210ENST00000513613 551 ntTSL 45.13□□□□□ -1.599e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.981e-9■■■■■ 51.7
XRCC6P12956 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-206ENST00000448673 652 ntTSL 59.94□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-203ENST00000421460 352 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 35.98□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 WWC2-207ENST00000508614 604 ntTSL 319.47■□□□□ 0.716e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.146e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.386e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.446e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-202ENST00000427431 6373 ntTSL 211.93□□□□□ -0.56e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-203ENST00000438543 3824 ntTSL 210.37□□□□□ -0.756e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 BCL9L-205ENST00000532899 611 ntTSL 517.74■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-202ENST00000372514 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-205ENST00000487556 2988 ntTSL 511.45□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 PAPD4-211ENST00000508620 483 ntTSL 418.16■□□□□ 0.59e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-215ENST00000514095 575 ntTSL 416.38■□□□□ 0.219e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-207ENST00000504233 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.159e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-217ENST00000515807 576 ntTSL 413.81□□□□□ -0.29e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-201ENST00000296783 3129 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.379e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.479e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.569e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-206ENST00000503620 582 ntTSL 38.79□□□□□ -19e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.339e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-209ENST00000505571 781 ntTSL 35.2□□□□□ -1.589e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 AP000781.2-203ENST00000528835 533 ntTSL 319.05■□□□□ 0.646e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 215.35■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.626e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 SLC43A3-226ENST00000625097 1796 nt8.99□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.011e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.481e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-208ENST00000511088 579 ntTSL 49.48□□□□□ -0.891e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 48.4
XRCC6P12956 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 48.4
XRCC6P12956 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.18□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.192e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.492e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-205ENST00000626262 1753 ntTSL 223.81■■□□□ 1.42e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.172e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 CHD2-217ENST00000629136 480 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 CHD2-206ENST00000625990 888 ntTSL 59.76□□□□□ -0.852e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.711e-12■■■■■ 48.1
XRCC6P12956 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-12■■■■■ 48.1
XRCC6P12956 PUM2-211ENST00000446940 525 ntTSL 416.33■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 415.44■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 59.46□□□□□ -0.92e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 55.54□□□□□ -1.522e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 55.23□□□□□ -1.572e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 54.88□□□□□ -1.632e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.483e-10■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 416.17■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 225.49■■□□□ 1.677e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-222ENST00000507229 2582 ntTSL 224.86■■□□□ 1.577e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.397e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.387e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.377e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 523.26■■□□□ 1.317e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 522.26■■□□□ 1.157e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.157e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.137e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.087e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.087e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.037e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.927e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 220.32■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-206ENST00000467597 776 ntTSL 220.01■□□□□ 0.797e-9■■■■■ 47.1
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