Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC61.91■■■■■ 7.5
TOP2AP11388 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC61.31■■■■■ 7.41
TOP2AP11388 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.43■■■■■ 7.26
TOP2AP11388 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC60.4■■■■■ 7.26
TOP2AP11388 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.91■■■■■ 7.18
TOP2AP11388 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.56■■■■■ 7.13
TOP2AP11388 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.4■■■■■ 7.1
TOP2AP11388 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC59.12■■■■■ 7.05
TOP2AP11388 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.58■■■■■ 6.97
TOP2AP11388 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC58.42■■■■■ 6.94
TOP2AP11388 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC58.37■■■■■ 6.93
TOP2AP11388 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC58.36■■■■■ 6.93
TOP2AP11388 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.06■■■■■ 6.88
TOP2AP11388 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC57.85■■■■■ 6.85
TOP2AP11388 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.81■■■■■ 6.84
TOP2AP11388 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC57.8■■■■■ 6.84
TOP2AP11388 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.56■■■■■ 6.81
TOP2AP11388 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
TOP2AP11388 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.34■■■■■ 6.77
TOP2AP11388 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC57.23■■■■■ 6.75
TOP2AP11388 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.83■■■■■ 6.69
TOP2AP11388 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.76■■■■■ 6.68
TOP2AP11388 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC56.76■■■■■ 6.68
TOP2AP11388 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
TOP2AP11388 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC56.69■■■■■ 6.66
TOP2AP11388 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.58■■■■■ 6.65
TOP2AP11388 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC56.52■■■■■ 6.64
TOP2AP11388 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.34■■■■■ 6.61
TOP2AP11388 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC56.34■■■■■ 6.61
TOP2AP11388 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.24■■■■■ 6.59
TOP2AP11388 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC56.23■■■■■ 6.59
TOP2AP11388 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.13■■■■■ 6.58
TOP2AP11388 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC55.79■■■■■ 6.52
TOP2AP11388 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC55.72■■■■■ 6.51
TOP2AP11388 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC55.68■■■■■ 6.5
TOP2AP11388 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.65■■■■■ 6.5
TOP2AP11388 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC55.44■■■■■ 6.47
TOP2AP11388 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC55.37■■■■■ 6.45
TOP2AP11388 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC55.19■■■■■ 6.43
TOP2AP11388 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
TOP2AP11388 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
TOP2AP11388 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC54.82■■■■■ 6.37
TOP2AP11388 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.79■■■■■ 6.36
TOP2AP11388 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.74■■■■■ 6.35
TOP2AP11388 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.67■■■■■ 6.34
TOP2AP11388 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
TOP2AP11388 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC54.44■■■■■ 6.3
TOP2AP11388 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC54.44■■■■■ 6.3
TOP2AP11388 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
TOP2AP11388 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC54.42■■■■■ 6.3
TOP2AP11388 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.27
TOP2AP11388 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
TOP2AP11388 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC54.05■■■■■ 6.24
TOP2AP11388 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC54.04■■■■■ 6.24
TOP2AP11388 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC54.04■■■■■ 6.24
TOP2AP11388 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
TOP2AP11388 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.77■■■■■ 6.2
TOP2AP11388 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
TOP2AP11388 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
TOP2AP11388 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.67■■■■■ 6.18
TOP2AP11388 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC53.67■■■■■ 6.18
TOP2AP11388 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC53.67■■■■■ 6.18
TOP2AP11388 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
TOP2AP11388 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC53.62■■■■■ 6.17
TOP2AP11388 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC53.62■■■■■ 6.17
TOP2AP11388 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.6■■■■■ 6.17
TOP2AP11388 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.54■■■■■ 6.16
TOP2AP11388 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC53.48■■■■■ 6.15
TOP2AP11388 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC53.45■■■■■ 6.15
TOP2AP11388 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC53.43■■■■■ 6.14
TOP2AP11388 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.41■■■■■ 6.14
TOP2AP11388 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.34■■■■■ 6.13
TOP2AP11388 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
TOP2AP11388 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.13
TOP2AP11388 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC53.24■■■■■ 6.11
TOP2AP11388 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC53.21■■■■■ 6.11
TOP2AP11388 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.1
TOP2AP11388 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.11■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC53.11■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC53.11■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.1■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC53.1■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.08■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
TOP2AP11388 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC52.99■■■■■ 6.07
TOP2AP11388 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC52.96■■■■■ 6.07
TOP2AP11388 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
TOP2AP11388 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.88■■■■■ 6.06
TOP2AP11388 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.85■■■■■ 6.05
TOP2AP11388 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.84■■■■■ 6.05
TOP2AP11388 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC52.75■■■■■ 6.03
TOP2AP11388 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.73■■■■■ 6.03
TOP2AP11388 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
TOP2AP11388 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC52.72■■■■■ 6.03
TOP2AP11388 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.72■■■■■ 6.03
TOP2AP11388 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC52.71■■■■■ 6.03
TOP2AP11388 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.62■■■■■ 6.01
TOP2AP11388 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC52.61■■■■■ 6.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms