Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CAPN1P07384 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CAPN1P07384 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CAPN1P07384 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAPN1P07384 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CAPN1P07384 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CAPN1P07384 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CAPN1P07384 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CAPN1P07384 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CAPN1P07384 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CAPN1P07384 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CAPN1P07384 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAPN1P07384 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CAPN1P07384 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAPN1P07384 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAPN1P07384 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CAPN1P07384 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CAPN1P07384 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPN1P07384 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAPN1P07384 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAPN1P07384 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAPN1P07384 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPN1P07384 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPN1P07384 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAPN1P07384 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPN1P07384 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAPN1P07384 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAPN1P07384 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPN1P07384 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPN1P07384 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPN1P07384 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN1P07384 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPN1P07384 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPN1P07384 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPN1P07384 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN1P07384 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN1P07384 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAPN1P07384 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPN1P07384 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN1P07384 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN1P07384 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN1P07384 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN1P07384 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPN1P07384 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN1P07384 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPN1P07384 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPN1P07384 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAPN1P07384 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN1P07384 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN1P07384 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN1P07384 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN1P07384 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPN1P07384 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN1P07384 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN1P07384 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN1P07384 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN1P07384 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN1P07384 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN1P07384 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN1P07384 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN1P07384 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN1P07384 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN1P07384 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN1P07384 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN1P07384 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN1P07384 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN1P07384 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN1P07384 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN1P07384 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN1P07384 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN1P07384 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN1P07384 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN1P07384 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN1P07384 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN1P07384 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN1P07384 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN1P07384 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN1P07384 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN1P07384 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN1P07384 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN1P07384 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPN1P07384 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN1P07384 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN1P07384 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN1P07384 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN1P07384 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN1P07384 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN1P07384 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN1P07384 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN1P07384 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN1P07384 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN1P07384 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN1P07384 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN1P07384 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN1P07384 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN1P07384 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN1P07384 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN1P07384 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN1P07384 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN1P07384 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms