Protein: O75940

SMNDC1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMNDC1O75940 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9not detected
SMNDC1O75940 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78not detected
SMNDC1O75940 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.691e-7■■■□□ 15.1
SMNDC1O75940 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.675e-6■■■■□ 22.7
SMNDC1O75940 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.662e-6■■■■□ 21
SMNDC1O75940 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63not detected
SMNDC1O75940 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6not detected
SMNDC1O75940 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.572e-6■■■□□ 15
SMNDC1O75940 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55not detected
SMNDC1O75940 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.512e-7■□□□□ 8.7
SMNDC1O75940 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5not detected
SMNDC1O75940 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48not detected
SMNDC1O75940 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.482e-7■■□□□ 11.9
SMNDC1O75940 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46not detected
SMNDC1O75940 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.467e-7■■■■□ 26.1
SMNDC1O75940 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41not detected
SMNDC1O75940 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39not detected
SMNDC1O75940 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37not detected
SMNDC1O75940 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35not detected
SMNDC1O75940 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35not detected
SMNDC1O75940 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35not detected
SMNDC1O75940 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35not detected
SMNDC1O75940 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33not detected
SMNDC1O75940 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33not detected
SMNDC1O75940 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32not detected
SMNDC1O75940 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31not detected
SMNDC1O75940 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31not detected
SMNDC1O75940 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31not detected
SMNDC1O75940 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31not detected
SMNDC1O75940 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3not detected
SMNDC1O75940 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3not detected
SMNDC1O75940 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29not detected
SMNDC1O75940 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28not detected
SMNDC1O75940 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27not detected
SMNDC1O75940 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27not detected
SMNDC1O75940 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27not detected
SMNDC1O75940 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.266e-9■■■□□ 16.4
SMNDC1O75940 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26not detected
SMNDC1O75940 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.255e-8■■■□□ 15.6
SMNDC1O75940 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.251e-7■■■□□ 15.1
SMNDC1O75940 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25not detected
SMNDC1O75940 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25not detected
SMNDC1O75940 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25not detected
SMNDC1O75940 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24not detected
SMNDC1O75940 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.244e-10■■■■□ 24.8
SMNDC1O75940 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24not detected
SMNDC1O75940 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.246e-11■■■■□ 20.7
SMNDC1O75940 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23not detected
SMNDC1O75940 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22not detected
SMNDC1O75940 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22not detected
SMNDC1O75940 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21not detected
SMNDC1O75940 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21not detected
SMNDC1O75940 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21not detected
SMNDC1O75940 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.28e-8■□□□□ 11
SMNDC1O75940 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.29e-6■■■■□ 24.8
SMNDC1O75940 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19not detected
SMNDC1O75940 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19not detected
SMNDC1O75940 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19not detected
SMNDC1O75940 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18not detected
SMNDC1O75940 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.182e-7■■■■■ 32.4
SMNDC1O75940 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18not detected
SMNDC1O75940 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17not detected
SMNDC1O75940 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15not detected
SMNDC1O75940 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15not detected
SMNDC1O75940 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15not detected
SMNDC1O75940 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15not detected
SMNDC1O75940 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14not detected
SMNDC1O75940 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.142e-6■■■□□ 15.6
SMNDC1O75940 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14not detected
SMNDC1O75940 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13not detected
SMNDC1O75940 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13not detected
SMNDC1O75940 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.135e-6■■■■□ 22.7
SMNDC1O75940 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12not detected
SMNDC1O75940 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12not detected
SMNDC1O75940 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11not detected
SMNDC1O75940 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.115e-6■■■■□ 26.3
SMNDC1O75940 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11not detected
SMNDC1O75940 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1not detected
SMNDC1O75940 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1not detected
SMNDC1O75940 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1not detected
SMNDC1O75940 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09not detected
SMNDC1O75940 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09not detected
SMNDC1O75940 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08not detected
SMNDC1O75940 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07not detected
SMNDC1O75940 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07not detected
SMNDC1O75940 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07not detected
SMNDC1O75940 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06not detected
SMNDC1O75940 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06not detected
SMNDC1O75940 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06not detected
SMNDC1O75940 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06not detected
SMNDC1O75940 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06not detected
SMNDC1O75940 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05not detected
SMNDC1O75940 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05not detected
SMNDC1O75940 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05not detected
SMNDC1O75940 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05not detected
SMNDC1O75940 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04not detected
SMNDC1O75940 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04not detected
SMNDC1O75940 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03not detected
SMNDC1O75940 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.033e-12■■□□□ 11.8
SMNDC1O75940 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms