Protein: O75940

SMNDC1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMNDC1O75940 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.455e-39■■■■■ 182.1
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SMNDC1O75940 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.825e-39■■■■■ 182.1
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SMNDC1O75940 PUM1-216ENST00000525997 650 ntTSL 34.65□□□□□ -1.672e-41■■■■■ 149.2
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SMNDC1O75940 TMEM222-202ENST00000464720 1665 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.192e-23■■■■■ 107.5
SMNDC1O75940 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-23■■■■■ 107.5
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SMNDC1O75940 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-23■■■■■ 107.5
SMNDC1O75940 TMEM222-207ENST00000478104 986 ntTSL 313.22□□□□□ -0.292e-23■■■■■ 107.5
SMNDC1O75940 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-23■■■■■ 107.5
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SMNDC1O75940 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.26e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.036e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-201ENST00000366521 860 ntTSL 210.93□□□□□ -0.666e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-213ENST00000497591 1201 ntTSL 510.7□□□□□ -0.76e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-208ENST00000473686 906 ntTSL 59.58□□□□□ -0.886e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-212ENST00000495271 744 ntTSL 59.28□□□□□ -0.926e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-211ENST00000487845 1389 ntTSL 28.3□□□□□ -1.086e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-204ENST00000391837 738 ntTSL 57.96□□□□□ -1.146e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.146e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-215ENST00000549220 557 ntTSL 47.26□□□□□ -1.256e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-216ENST00000551317 520 ntTSL 36.95□□□□□ -1.36e-23■■■■■ 105.2
SMNDC1O75940 EFCAB2-205ENST00000425550 550 ntTSL 36.32□□□□□ -1.46e-23■■■■■ 105.2
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SMNDC1O75940 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 58.53□□□□□ -1.042e-22■■■■■ 95.4
SMNDC1O75940 CDK5RAP2-207ENST00000468989 577 ntTSL 46.82□□□□□ -1.322e-22■■■■■ 95.4
SMNDC1O75940 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.02□□□□□ -1.936e-49■■■■■ 94.5
SMNDC1O75940 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.562e-21■■■■■ 93.4
SMNDC1O75940 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-68■■■■■ 93.1
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