Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NPM3O75607 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NPM3O75607 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NPM3O75607 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NPM3O75607 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NPM3O75607 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NPM3O75607 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NPM3O75607 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
NPM3O75607 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NPM3O75607 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NPM3O75607 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NPM3O75607 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NPM3O75607 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NPM3O75607 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NPM3O75607 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NPM3O75607 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NPM3O75607 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NPM3O75607 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NPM3O75607 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NPM3O75607 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NPM3O75607 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NPM3O75607 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NPM3O75607 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NPM3O75607 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NPM3O75607 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NPM3O75607 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NPM3O75607 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NPM3O75607 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NPM3O75607 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NPM3O75607 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPM3O75607 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NPM3O75607 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPM3O75607 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NPM3O75607 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NPM3O75607 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NPM3O75607 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NPM3O75607 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NPM3O75607 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NPM3O75607 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
NPM3O75607 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NPM3O75607 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NPM3O75607 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NPM3O75607 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
NPM3O75607 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NPM3O75607 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NPM3O75607 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPM3O75607 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPM3O75607 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NPM3O75607 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NPM3O75607 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NPM3O75607 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NPM3O75607 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NPM3O75607 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NPM3O75607 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NPM3O75607 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NPM3O75607 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NPM3O75607 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NPM3O75607 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NPM3O75607 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NPM3O75607 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NPM3O75607 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
NPM3O75607 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NPM3O75607 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NPM3O75607 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPM3O75607 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPM3O75607 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NPM3O75607 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NPM3O75607 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NPM3O75607 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NPM3O75607 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NPM3O75607 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NPM3O75607 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NPM3O75607 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NPM3O75607 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NPM3O75607 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NPM3O75607 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NPM3O75607 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NPM3O75607 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NPM3O75607 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NPM3O75607 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NPM3O75607 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NPM3O75607 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NPM3O75607 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NPM3O75607 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NPM3O75607 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NPM3O75607 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NPM3O75607 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NPM3O75607 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NPM3O75607 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NPM3O75607 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NPM3O75607 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NPM3O75607 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NPM3O75607 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NPM3O75607 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NPM3O75607 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NPM3O75607 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NPM3O75607 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NPM3O75607 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NPM3O75607 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPM3O75607 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms