Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51not detected
SF3B1O75533 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.399e-6■■■■■ 68.9
SF3B1O75533 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.353e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33not detected
SF3B1O75533 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.322e-6■■■■■ 63.4
SF3B1O75533 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.312e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29not detected
SF3B1O75533 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28not detected
SF3B1O75533 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15not detected
SF3B1O75533 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.142e-6■■■■□ 23
SF3B1O75533 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13not detected
SF3B1O75533 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13not detected
SF3B1O75533 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.129e-7■■■■■ 57.4
SF3B1O75533 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.129e-7■■■■■ 57.4
SF3B1O75533 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11not detected
SF3B1O75533 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.083e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07not detected
SF3B1O75533 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05not detected
SF3B1O75533 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.053e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04not detected
SF3B1O75533 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03not detected
SF3B1O75533 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01not detected
SF3B1O75533 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01not detected
SF3B1O75533 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98not detected
SF3B1O75533 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97not detected
SF3B1O75533 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97not detected
SF3B1O75533 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96not detected
SF3B1O75533 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95not detected
SF3B1O75533 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.949e-6■■■■■ 68.9
SF3B1O75533 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.942e-10■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.932e-13■■■■■ 100.5
SF3B1O75533 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92not detected
SF3B1O75533 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88not detected
SF3B1O75533 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.873e-6■■■■■ 145.3
SF3B1O75533 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.879e-7■■■■■ 57.4
SF3B1O75533 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.872e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.859e-10■■■■□ 24.3
SF3B1O75533 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85not detected
SF3B1O75533 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85not detected
SF3B1O75533 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.858e-7■■■■■ 56.1
SF3B1O75533 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84not detected
SF3B1O75533 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84not detected
SF3B1O75533 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83not detected
SF3B1O75533 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83not detected
SF3B1O75533 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.821e-6■■■■■ 132.1
SF3B1O75533 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82not detected
SF3B1O75533 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8not detected
SF3B1O75533 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.795e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77not detected
SF3B1O75533 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77not detected
SF3B1O75533 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.779e-6■■■■■ 68.9
SF3B1O75533 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76not detected
SF3B1O75533 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75not detected
SF3B1O75533 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.754e-6■■■■■ 98.5
SF3B1O75533 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.752e-7■■■■■ 44.8
SF3B1O75533 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74not detected
SF3B1O75533 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.732e-7■■■■■ 82.1
SF3B1O75533 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72not detected
SF3B1O75533 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.712e-6■■■■■ 85
SF3B1O75533 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.713e-6■■■■■ 145.3
SF3B1O75533 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.717e-8■■■■■ 58.7
SF3B1O75533 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71not detected
SF3B1O75533 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.712e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7not detected
SF3B1O75533 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7not detected
SF3B1O75533 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7not detected
SF3B1O75533 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7not detected
SF3B1O75533 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.699e-6■■■■■ 87.9
SF3B1O75533 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69not detected
SF3B1O75533 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69not detected
SF3B1O75533 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.692e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68not detected
SF3B1O75533 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.672e-6■■■■■ 55.3
SF3B1O75533 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67not detected
SF3B1O75533 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.671e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.673e-11■■■■■ 85.9
SF3B1O75533 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.664e-6■■■■□ 26.1
SF3B1O75533 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66not detected
SF3B1O75533 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.667e-7■■■■■ 86
SF3B1O75533 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.657e-9■■■■■ 80.4
SF3B1O75533 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.657e-9■■■■■ 80.4
SF3B1O75533 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.659e-7■■■■■ 57.4
SF3B1O75533 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65not detected
SF3B1O75533 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.652e-6■■■■■ 132.3
SF3B1O75533 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64not detected
SF3B1O75533 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64not detected
SF3B1O75533 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64not detected
SF3B1O75533 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63not detected
SF3B1O75533 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63not detected
SF3B1O75533 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62not detected
SF3B1O75533 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.622e-11■■■■■ 41.6
SF3B1O75533 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.622e-11■■■■■ 62
SF3B1O75533 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.44■■■□□ 2.622e-11■■■■■ 62
SF3B1O75533 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.624e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.624e-8■■□□□ 13.3
SF3B1O75533 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62not detected
SF3B1O75533 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.614e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.614e-6■■■■□ 26.1
SF3B1O75533 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 402.5 ms