Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B1O75533 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.84□□□□□ -2.127e-33■■■■■ 320.9
SF3B1O75533 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 51.27□□□□□ -2.217e-33■■■■■ 320.9
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SF3B1O75533 ARFGAP3-202ENST00000435208 501 ntTSL 38.12□□□□□ -1.118e-26■■■■■ 585.9
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SF3B1O75533 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-25■■■■■ 568
SF3B1O75533 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.151e-25■■■■■ 568
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SF3B1O75533 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-25■■■■■ 568
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SF3B1O75533 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-25■■■■■ 292.9
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SF3B1O75533 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-23■■■■■ 413.6
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SF3B1O75533 SETD4-212ENST00000446166 754 ntTSL 312.39□□□□□ -0.432e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-202ENST00000399201 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-204ENST00000399207 1160 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-218ENST00000514907 633 ntTSL 510.32□□□□□ -0.762e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-209ENST00000429161 745 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-23■■■■■ 275.7
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SF3B1O75533 SLC35B1-215ENST00000511657 548 ntTSL 39.11□□□□□ -0.952e-23■■■■■ 275.7
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SF3B1O75533 SETD4-216ENST00000485865 549 ntTSL 26.22□□□□□ -1.412e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-213ENST00000508926 393 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-23■■■■■ 275.7
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SF3B1O75533 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.048e-23■■■■■ 229.8
SF3B1O75533 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.849e-23■■■■■ 516.9
SF3B1O75533 FOXK2-208ENST00000571160 496 ntTSL 514.32□□□□□ -0.129e-23■■■■■ 516.9
SF3B1O75533 KIF22-209ENST00000569636 834 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-22■■■■■ 117.2
SF3B1O75533 KIF22-210ENST00000570173 562 ntTSL 513.78□□□□□ -0.21e-22■■■■■ 117.2
SF3B1O75533 TRIM41-206ENST00000514219 459 ntTSL 517.03■□□□□ 0.321e-22■■■■■ 183.8
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