Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B1O75533 MZT2A-203ENST00000427024 679 ntTSL 318.88■□□□□ 0.613e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 LRWD1-208ENST00000485808 908 ntTSL 518.67■□□□□ 0.583e-18■■■■■ 413.6
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SF3B1O75533 LRWD1-205ENST00000473880 5491 ntTSL 215.39■□□□□ 0.063e-18■■■■■ 413.6
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SF3B1O75533 ANKRD13B-202ENST00000487527 3023 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.023e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 CAPZB-206ENST00000457768 432 ntTSL 313.52□□□□□ -0.251e-23■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 MYO3B-206ENST00000442690 1720 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.383e-18■■■■■ 413.6
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SF3B1O75533 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 405.8
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SF3B1O75533 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 MIB2-230ENST00000514363 592 ntTSL 318.56■□□□□ 0.561e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 GNPDA1-211ENST00000510194 570 ntTSL 418.19■□□□□ 0.51e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 ASB13-202ENST00000459912 2780 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.341e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.121e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 MIB2-209ENST00000477990 2821 ntTSL 214.21□□□□□ -0.141e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.141e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-207ENST00000505689 925 ntTSL 514.03□□□□□ -0.161e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-208ENST00000559153 1918 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.271e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-203ENST00000503229 543 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 GNPDA1-202ENST00000500692 2319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.521e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ST3GAL1-210ENST00000522285 393 ntTSL 311.46□□□□□ -0.571e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 GNPDA1-201ENST00000311337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 RDH16-201ENST00000360752 3198 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.821e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.051e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-224ENST00000636874 126 ntTSL 57.03□□□□□ -1.281e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-219ENST00000636103 128 ntTSL 54.99□□□□□ -1.611e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ZSWIM8-204ENST00000431225 1687 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-21■■■■■ 370.5
SF3B1O75533 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.511e-20■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-201ENST00000338427 779 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-15■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-206ENST00000475952 983 ntTSL 212.49□□□□□ -0.412e-15■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-210ENST00000493613 613 ntTSL 311.35□□□□□ -0.592e-15■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-209ENST00000487118 314 ntTSL 39.03□□□□□ -0.962e-15■■■■■ 361.9
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SF3B1O75533 USP36-209ENST00000587783 679 ntTSL 324.35■■□□□ 1.492e-18■■■■■ 347.6
SF3B1O75533 USP36-212ENST00000588365 546 ntTSL 422.95■■□□□ 1.262e-18■■■■■ 347.6
SF3B1O75533 USP36-222ENST00000592275 594 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-18■■■■■ 347.6
SF3B1O75533 TP53INP2-204ENST00000451665 477 ntTSL 522.74■■□□□ 1.238e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 TP53INP2-203ENST00000414082 442 ntTSL 317.17■□□□□ 0.348e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.38e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 PACSIN2-211ENST00000507586 362 ntTSL 36.85□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 346.4
SF3B1O75533 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.253e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 FBF1-211ENST00000593076 854 ntTSL 521.62■■□□□ 1.053e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SHISA7-202ENST00000416792 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.13■□□□□ 0.973e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SLC39A4-207ENST00000531013 795 ntTSL 220.67■□□□□ 0.93e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.833e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.823e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SCAPER-211ENST00000564177 576 ntTSL 419.87■□□□□ 0.773e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SCAPER-214ENST00000565372 572 ntTSL 419.87■□□□□ 0.773e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.773e-15■■■■■ 344.6
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