Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B1O75533 CHURC1-FNTB-202ENST00000551823 517 ntTSL 22.97□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 426.2
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SF3B1O75533 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.843e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-208ENST00000572350 713 ntTSL 326.25■■□□□ 1.793e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-204ENST00000571213 683 ntTSL 226.02■■□□□ 1.763e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.53e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 PTOV1-205ENST00000595934 1880 nt24.4■■□□□ 1.53e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-212ENST00000573367 711 ntTSL 224.22■■□□□ 1.473e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-209ENST00000572671 656 ntTSL 223.94■■□□□ 1.423e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.43e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 ZNF264-204ENST00000597447 681 ntTSL 323.79■■□□□ 1.43e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-202ENST00000536038 1883 ntTSL 223.44■■□□□ 1.343e-18■■■■■ 413.6
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SF3B1O75533 ZNF264-203ENST00000594126 359 ntTSL 322.94■■□□□ 1.263e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-219ENST00000575360 754 ntTSL 322.88■■□□□ 1.253e-18■■■■■ 413.6
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SF3B1O75533 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.123e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 ANKRD13B-208ENST00000583728 582 ntTSL 420.66■□□□□ 0.93e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-221ENST00000577065 874 ntTSL 320.3■□□□□ 0.843e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-213ENST00000573576 465 ntTSL 319.99■□□□□ 0.793e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 SIRT7-206ENST00000571832 2511 ntTSL 219.72■□□□□ 0.753e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.743e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 LRWD1-202ENST00000463739 1062 ntTSL 519.51■□□□□ 0.713e-18■■■■■ 413.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 563.3 ms