Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 SH3BP2-209ENST00000504450 844 ntTSL 511.81□□□□□ -0.527e-34■■■■■ 150.2
DKC1O60832 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 319.32■□□□□ 0.681e-323■■■■■ 147.3
DKC1O60832 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 PPP1R8-204ENST00000431586 1029 ntTSL 313.9□□□□□ -0.181e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.84□□□□□ -1.791e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 211.66□□□□□ -0.542e-30■■■■■ 146.3
DKC1O60832 MATR3-235ENST00000506147 580 ntTSL 417.79■□□□□ 0.441e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-239ENST00000514694 587 ntTSL 417.23■□□□□ 0.351e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-238ENST00000512107 579 ntTSL 416.2■□□□□ 0.181e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-203ENST00000506188 801 ntTSL 415.83■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-201ENST00000448190 542 ntTSL 414.96□□□□□ -0.011e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-236ENST00000509644 750 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-202ENST00000505522 629 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-208ENST00000514110 679 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-206ENST00000508735 310 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 413.54□□□□□ -0.241e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.331e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-207ENST00000513259 444 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.991e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.451e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-205ENST00000507692 575 ntTSL 55.66□□□□□ -1.51e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC8.29□□□□□ -1.085e-25■■■■■ 140.2
DKC1O60832 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.051e-323■■■■■ 139.7
DKC1O60832 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-210ENST00000482415 3602 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.341e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.521e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.551e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-213ENST00000605242 566 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-202ENST00000572793 498 ntTSL 58.5□□□□□ -1.052e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-208ENST00000604133 542 ntTSL 55.06□□□□□ -1.62e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 511.83□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.26e-31■■■■■ 137.3
DKC1O60832 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.74■□□□□ 0.751e-323■■■■■ 137.3
DKC1O60832 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.37■□□□□ 0.691e-323■■■■■ 137.3
DKC1O60832 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 136.7
DKC1O60832 PSD3-207ENST00000518315 1806 ntTSL 214.17□□□□□ -0.146e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-217ENST00000521878 733 ntTSL 510.69□□□□□ -0.76e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.046e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.156e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.26e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.296e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.386e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.446e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.16□□□□□ -1.421e-30■■■■■ 136.3
DKC1O60832 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 134.7
DKC1O60832 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 134.7
DKC1O60832 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 134.7
DKC1O60832 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-323■■■■■ 133.4
DKC1O60832 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-323■■■■■ 133.4
DKC1O60832 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 SNHG21-202ENST00000558174 725 ntTSL 216.01■□□□□ 0.154e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.154e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.144e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.92□□□□□ -1.464e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.44e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 216.93■□□□□ 0.36e-12■■■■■ 130.4
DKC1O60832 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.768e-8■■■■■ 129.3
DKC1O60832 RPSA-203ENST00000444512 701 ntTSL 221.39■■□□□ 1.011e-323■■■■■ 129.1
DKC1O60832 RPSA-206ENST00000477325 596 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-323■■■■■ 129.1
DKC1O60832 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.021e-323■■■■■ 129.1
DKC1O60832 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.424e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 126.2
DKC1O60832 CCT6A-208ENST00000493855 261 ntTSL 23.07□□□□□ -1.922e-65■■■■■ 123.8
DKC1O60832 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.332e-65■■■■■ 123.8
DKC1O60832 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 212.7□□□□□ -0.387e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.997e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.32□□□□□ -1.087e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.27e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.297e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 122.3
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 320.3 ms