Protein: O60508

CDC40, Pre-mRNA-processing factor 17, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC40O60508 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-47■■■■■ 107.7
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CDC40O60508 LRRC27-202ENST00000368612 1765 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 53.4
CDC40O60508 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 53.4
CDC40O60508 LRRC27-206ENST00000462656 2302 ntTSL 29.59□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 53.4
CDC40O60508 LRRC27-208ENST00000472556 646 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 53.4
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CDC40O60508 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 48
CDC40O60508 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 48
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CDC40O60508 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 38.32□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 47.6
CDC40O60508 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 47.06□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 47.6
CDC40O60508 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-9■■■■■ 47.6
CDC40O60508 CNNM4-204ENST00000496186 748 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-9■■■■■ 47.6
CDC40O60508 SLC7A1-202ENST00000450494 547 ntTSL 215.93■□□□□ 0.146e-11■■■■■ 47.3
CDC40O60508 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.486e-11■■■■■ 47.3
CDC40O60508 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 46.4
CDC40O60508 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 221.97■■□□□ 1.117e-13■■■■■ 46
CDC40O60508 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 221.78■■□□□ 1.087e-13■■■■■ 46
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CDC40O60508 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 319.24■□□□□ 0.674e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.594e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 318.36■□□□□ 0.534e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.484e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 216.68■□□□□ 0.264e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 215.9■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 214.24□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 44.9
CDC40O60508 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 43.1
CDC40O60508 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.232e-9■■■■■ 43.1
CDC40O60508 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.191e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 515.67■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 415.32■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 414.78□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 413.17□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 SRC-211ENST00000497734 446 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 42.3
CDC40O60508 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.675e-80■■■■■ 41.9
CDC40O60508 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.667e-9■■■■■ 40.3
CDC40O60508 WDR82-204ENST00000487402 4333 ntTSL 29.47□□□□□ -0.897e-9■■■■■ 40.3
CDC40O60508 TNFSF14-201ENST00000245912 4336 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.848e-8■■■■■ 39.9
CDC40O60508 ARHGEF16-207ENST00000485984 2340 ntTSL 215.94■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 39.6
CDC40O60508 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.414e-8■■■■■ 39.6
CDC40O60508 PFKL-208ENST00000491298 819 ntTSL 513.67□□□□□ -0.229e-11■■■■■ 39.2
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CDC40O60508 ERBB3-219ENST00000551242 2755 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 37.8
CDC40O60508 ERBB3-216ENST00000550869 572 ntTSL 410.94□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 37.8
CDC40O60508 ERBB3-217ENST00000551085 4382 ntTSL 210.71□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 37.8
CDC40O60508 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 37.8
CDC40O60508 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)9.27□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 37.8
CDC40O60508 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -13e-8■■■■■ 37.8
CDC40O60508 ERBB3-211ENST00000549644 306 ntTSL 38.03□□□□□ -1.123e-8■■■■■ 37.8
CDC40O60508 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.251e-323■■■■■ 37.2
CDC40O60508 CHID1-216ENST00000529539 602 ntTSL 219.67■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-218ENST00000531010 408 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-223ENST00000534207 1171 ntTSL 516.3■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-214ENST00000528534 321 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 NELFCD-207ENST00000479207 1112 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 210.06□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 59.83□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CHID1-213ENST00000528521 323 ntTSL 58.94□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 NELFCD-206ENST00000478389 3581 ntTSL 27.62□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 NELFCD-212ENST00000497935 666 ntTSL 25.58□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 37
CDC40O60508 CLMN-202ENST00000553733 565 ntTSL 416.87■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 36.8
CDC40O60508 CLMN-204ENST00000555615 685 ntTSL 58.54□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 36.8
CDC40O60508 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 36.8
CDC40O60508 CLMN-203ENST00000555336 718 ntTSL 55.41□□□□□ -1.546e-8■■■■■ 36.8
CDC40O60508 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 36.8
CDC40O60508 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 36.8
CDC40O60508 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 36.8
CDC40O60508 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.974e-8■■■■■ 36.5
CDC40O60508 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 36.5
CDC40O60508 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 512.91□□□□□ -0.344e-8■■■■■ 36.5
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